지식나눔

single cell transcriptome 내지 single cell 연구가 주목받는 이유가 무엇인지요

얼마 전에 nature 저널에서
single cell transcriptome에 대한 논문을 봤습니다
정확히 말씀드리면 제목만 봤지요

이 분야가 왜 핫이슈가 되나요?

생명현상을 이해하는 데 있어서
single cell 수준에서 이해하는 것이
정확한 생명현상을 설명할 수 있으니까
라고 단순하게 생각했는데
이 연구가 nature에 실릴만한 연구인지요?

제가 훌륭한 연구를 알아보는 능력이 없는가 봐요

예전부터 single cell을 분리하기 위해
laser dissection or FACS를 이용한 연구들이 있어왔잖아요

그런데 왜 지금와서 이 연구가 주목을 받지요?

그리고
굳이 single cell이 아니더라도
homogeneous cells 이면
single cell과 같은 연구 결과가 나올 것 같다는 생각이 들었는데요

제 생각이 이상한가요?

아시는 분들 답변 부탁드립니다

감사합니다
  • single cell transcriptome
  • single cell 연구
  • nature
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답변 4
  • 답변

    임창임님의 답변

    single cell transcriptome은 cancer heterogeneity, brain development 및 줄기세포의 단계별 분화 등을 연구하는 데  사용하는 연구 방법입니다.

    예를 들어 암의 경우 종양을 구성하는 세포의 특성이 단일하지 않고 다른 양상 (이질성)을 보이기 때문에 이에 대한 치료법도 그에 맞게 대응할 필요가 있습니다.
    최근 이를 위한 방법으로 single cell transcriptome을 이용하는 시도가 증가하고 있습니다만, 그 비용이 아직 일반적인 microarray 만큼 저렴하지 않고 여러 면에서 극복해야 할 사안들이 있습니다. 

    이에 관한 참고 문헌 첨부합니다.
    도움 되길 바랍니다.

     
    single cell transcriptome은 cancer heterogeneity, brain development 및 줄기세포의 단계별 분화 등을 연구하는 데  사용하는 연구 방법입니다.

    예를 들어 암의 경우 종양을 구성하는 세포의 특성이 단일하지 않고 다른 양상 (이질성)을 보이기 때문에 이에 대한 치료법도 그에 맞게 대응할 필요가 있습니다.
    최근 이를 위한 방법으로 single cell transcriptome을 이용하는 시도가 증가하고 있습니다만, 그 비용이 아직 일반적인 microarray 만큼 저렴하지 않고 여러 면에서 극복해야 할 사안들이 있습니다. 

    이에 관한 참고 문헌 첨부합니다.
    도움 되길 바랍니다.

     

    네..
    완전하지는 않지만 어느 정도는 이해가 됩니다
    좀 더 정확한 이해는 첨부해 주신 문헌을 읽어 보면 되겠지요?^^

  • 답변

    박애리님의 답변

    사람마다 비슷한 공통점은 가지고 있어도 유전자 정보는 모두 다를것이고 
    그에 따라 질병 및 건강 상태를 체크해서 개개인의 맞춤형 치료법을 하는 것이 미래의 헬스케어라고 보고 있어서 소량의 환자샘플로  환자의 현상태에 대해 최대한 많은 정보로 분석 및 결과 예측 가능하게 만들려는 연구 아닐까 싶네요 

    그리고 현재 줄기세포 치료쪽에서는 아무래도 마지막에 걸리는 문제가 면역인데 
    자기자신의 조직 및 세포를 추출해서 분석 및 세포치료를 하는 것이 
    다른 종간으로 부터의 세포 치료나 다른 사람으로부터 얻은 샘플로의 세포치료하는 것보다는 훨씬 안전성이 있다는 전제조건이 붙기 때문에 .... 그런거 아닐까싶습니다. 
    사람마다 비슷한 공통점은 가지고 있어도 유전자 정보는 모두 다를것이고 
    그에 따라 질병 및 건강 상태를 체크해서 개개인의 맞춤형 치료법을 하는 것이 미래의 헬스케어라고 보고 있어서 소량의 환자샘플로  환자의 현상태에 대해 최대한 많은 정보로 분석 및 결과 예측 가능하게 만들려는 연구 아닐까 싶네요 

    그리고 현재 줄기세포 치료쪽에서는 아무래도 마지막에 걸리는 문제가 면역인데 
    자기자신의 조직 및 세포를 추출해서 분석 및 세포치료를 하는 것이 
    다른 종간으로 부터의 세포 치료나 다른 사람으로부터 얻은 샘플로의 세포치료하는 것보다는 훨씬 안전성이 있다는 전제조건이 붙기 때문에 .... 그런거 아닐까싶습니다. 
    등록된 댓글이 없습니다.
  • 답변

    조준석님의 답변

    조직을 샘플로 사용하신다면 조직내 모든 종류 세포의 유전자 발현을 동시에 볼 수 있는 장점이 있습니다.
    조직을 샘플로 사용하신다면 조직내 모든 종류 세포의 유전자 발현을 동시에 볼 수 있는 장점이 있습니다.
    등록된 댓글이 없습니다.
  • 답변

    황규찬님의 답변

    ** 예전에는 상상도 못했습니다. 하나의 세포에서 전체 trancriptome를 분석한다는것이 하지만, Ab에 대한 FACS sorting이 가능해 지면서 효율이 낮은 세포수준의 여러 분야에서 매우 중요하게 되었고 원하는 하나의 세포로 부터 증식할 수 있기 때문에 비용 및 시간을 절약할 수 있게 됩니다.
    ** 예전에는 상상도 못했습니다. 하나의 세포에서 전체 trancriptome를 분석한다는것이 하지만, Ab에 대한 FACS sorting이 가능해 지면서 효율이 낮은 세포수준의 여러 분야에서 매우 중요하게 되었고 원하는 하나의 세포로 부터 증식할 수 있기 때문에 비용 및 시간을 절약할 수 있게 됩니다.

    하나의 세포만을 sorting 해서 sorting 된 세포를 증식시키는 거죠? 증식된 그 세포를 가지고 sequencing을 하는 개념이 맞는 거죠?