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각 분야 한인연구자와 현업 전문가분들의 답변을 기다립니다.
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답변
김형택님의 답변
2019-05-19- 7
FACS protocol을 공유해 드립니다.
Flow Cytometry Protocol for Human Peripheral Blood Mononuclear Cells (PBMC)
A. Solutions and Reagents
1. 20X Phosphate Buffered Saline (PBS): (#9808) To prepare 1 L 1X PBS: add 50 ml 20X PBS to 950 ml dH2O, mix.
2. Formaldehyde (methanol free).
3. 2% Formaldehyde (stock formaldehyde diluted in PBS; make fresh on day of experiment).
4. Triton™ X-100.
5. Ficoll-Paque™.
6. Incubation Buffer: Dissolve 0.5 g bovine serum albumin (BSA) (#9998) in 100 ml 1X PBS. Store at 4°C.
B. Fixation
1. Isolate PBMCs from whole blood by Ficoll density centrifugation as per manufacturer’s instructions.
2. Wash 2x by centrifugation using Incubation Buffer.
3. Resuspend cells in Incubation Buffer and aliquot at a concentration of 1 x 106 cells/100 µl/sample tube.
4. Aspirate supernatant and resuspend cells in 500 µl of 2% formaldehyde.
5. Fix for 30 min at room temperature.
6. Wash 2X by centrifugation in Incubation Buffer.
C. Permeabilization
1. Resuspend cells in 1 ml of 0.1% Triton™ X-100 (v/v in PBS).
2. Let stand for 30 min at room temperature.
3. Wash 2X by centrifugation in Incubation Buffer.
D. Immunostaining
1. Resuspend cell pellets in 100 µl of Antibody working solution (stock antibody diluted 1:200 in Incubation Buffer).
2. Incubate for 1 hr at room temperature.
3. Wash 2X by centrifugation in Incubation Buffer.
4. If using a fluorochrome-conjugated primary antibody, resuspend cells in 500 µl of Incubation Buffer and analyze on flow cytometer; for unconjugated or biotinylated primary antibodies, proceed to Step 5.
5. Resuspend cells in fluorochrome-conjugated secondary antibody or fluorochrome-conjugated avidin, diluted in Incubation Buffer at the recommended dilution.
6. Incubate for 30 min at room temperature.
7. Wash 2X by centrifugation in Incubation Buffer.
8. Resuspend cells in 500 µl of Incubation Buffer and analyze on flow cytometer.
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답변
한민준님의 답변
2019-05-17- 6
antibody로 먼저 stain하시고 fix 하시면 flow analysis하시는데 별 문제 없습니다만 이게 cell type과 antibody에 따라 편차가 매우 커서요.. 정확한것을 보시려면 먼저 조건을 잡으신 (live cell, fixing cell) 다음에 실험을 진행하시는 것을 추천합니다.
또한 이 경우 live marker로 사용하는 DAPI등을 사용하실수는 없습니다. -
답변
성경주님의 답변
2019-05-20- 4
1. 세포 준비하시고 고정합니다 (실험 그룹별로 나누어서)
2. 투과 : 확인하고자 하는 단백질이 세포 안에 존재할 경우 100% 메탄올 넣고 볼텍싱 후 90% 메타올로 농도 유지해서 아이스에서 incubation
3. 염색 : 샘플 튜브에 적정 세포를 분주해서 인큐베이션버퍼 (serum+pbs) 2~3ml 넣고 centrifuge (낮음 rpm) 한 후에 상온에서 100ul 인큐베이션 버퍼 넣고 10분간 놔둔후 안티바디(2nd conjugate) 넣고 1시간 incubation합니다. 워싱한 다음에 장비에 넣고 분석하시면 됩니다. (24시간 이내) -
답변
손영옥님의 답변
2019-05-17- 3
가능합니다. 하지만 염색후 1시간이내에 분석을 완료해야 합니다. -
답변
서기원님의 답변
2019-05-17- 3
Fixation 후 FACS 분석은 매우 일반적으로 사용합니다.
특히 surface molecules 가 아니라, cytosol의 물질 분석에는 Permeabilization and Fixation을 진행하죠.
구글에 검색하시면 일반적인 protocol 많이 나옵니다. BD같은 제조사에서 전용 고정시약도 많이 판매하고요..
다만, fix를 할 경우 target 단백질의 성질(구조, charge 등) 의 변화가 생길 가능성이 있고, 따라서 경우에 따라 검출이 잘 안될 수도 있습니다. 이부분은 실험을 해봐야만 알 수 있습니다.
보통 이런 문제가 발행하면 fixatioin sol의 종류를 바꾸거나 항체를 다른 항체로 변경(다른 epitope를 가지는) 하여 진행하기도 합니다. -
답변
이광호님의 답변
2019-05-20- 2
가능 합니다.
하지만 시간이 너무 오래되면 분석이 안좋았던 경험이 있습니다.
저는 고정 후 반나절 까지는 큰 무리는 없었습니다 최상의 상태는 아닐지라도. -
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조준석님의 답변
2019-05-23- 2
다들 좋은 정보 주셨듯이 일반적으로 쓰는 방법입니다. -
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DELETED님의 답변
2019-07-19- 0
회원님의 직접적인 의견이 아닌 경우 출처를 달아주세요.