2020-01-28
org.kosen.entty.User@2eb3018a
손영옥(sounagi1)
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안녕하세요? 혹시 지방에서도 RNA 축출 가능하는지요?
배양된 지방세포에서는 RNA 축출하여 PCR등 관련 실험이 가능할것 같은데 동물의 성체의 지방에서 RNA을 축출하여 PCR, RNA-Seq등을 할수 있을까 하는 의문이 들어 질문 들여 봅니다.
경험 있으신분들 답변 부탁드립니다.
배양된 지방세포에서는 RNA 축출하여 PCR등 관련 실험이 가능할것 같은데 동물의 성체의 지방에서 RNA을 축출하여 PCR, RNA-Seq등을 할수 있을까 하는 의문이 들어 질문 들여 봅니다.
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- 지방
- RNA 축출
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각 분야 한인연구자와 현업 전문가분들의 답변을 기다립니다.
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답변 5
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답변
변경필님의 답변
2020-01-28- 4
정확하게 말씀드리면 지방조직(지방+세포)에서 지방세포의 RNA를 추출 할 수 있습니다.
일반적인 TRI Reagent를 사용하거나, miRNeasy(Qiagen)kit를 많이 사용하여 RNA를 추출합니다.
관련 논문 한편을 올려 드리니 참고해서 사용하시기 편안한 방법으로 RNA를 추출하여 다음 단계의 시험 하시면 될 것 같습니다.
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답변
김형택님의 답변
2020-01-28- 2
Collagenase을 처리해서 지방을 녹인 다음에 다운 시켜서 나온 pellet에서 RNA를 추출하시면 될 것 같습니다.
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답변
조준석님의 답변
2020-01-29- 2
지방세포와 SVF를 분리하여 각각의 RNA 얻으실수 있습니다. 필요에 따라 FACS를 통해 cell type을 더 분리하여 RNA뽑으시는것도 가능합니다. -
답변
이상후님의 답변
2020-02-07- 0
참고적으로, adipotissue라는 지방조직에서 adipocyte라는 지방세포에 있는 RNA를 추출할 수 있는데, 보통 RNAseq 분석을 하고자 한다면 total RNA를 우선 추출후에 여기에 포함되어 있으며 상당부분을 차지하는 일종의 contaminant로서 여겨지는 rRNA를 제거하고 나머지 mRNA에 대해서 cDNA로 전환시켜 분석을 진행합니다. RNA자체가 stability가 낮기 때문에 분리 즉시 실험에 사용하거나 분리 후 -70'C 이하에서 보관하는 것이 좋습니다. -
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이광호님의 답변
2020-04-21- 0
지방에서 RNA 추출 가능합니다.
하지만 확실히 확률이 떨어지고 어렵기는 합니다.
지방조직을 갈아서 처리하는 과정에서 빠르고 신속하고 그리고 오염되지 않게 진행하여야 합니다.
그리고 복잡한 과정을 생략하기 위해서 최대한 시중에 나와있는 RNA추출 키트를 이용하는 것이 좋습니다. 최대한 과정이 적고 효율이 높은 제품으로 구입해서 하십시요.
지방조직에서는 돈을 좀 쓰는게 더 아끼는 방법이기도 합니다.
그리고 보관도 중요하긴 한데 최대한 한번에 필요한 양을 시험하시고 거의 건들지 않는다는 생각으로 -70도에 보관하십시요. 한두번안에 다 쓴다는 생각으로