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지식나눔

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단백질 구조와 리간드를 볼때 보통 어떤 프로그램을 사용하시는지 궁금합니다.

2020-06-05 org.kosen.entty.User@6cdc2ecb 양현모(yymomo)
  • 1
보통 단백질과 리간드의 binding을 확인하면서 화합물을 design 하는데 회원님들은
어떤 프로그램을 사용하시면서 효율을 높이시는지 궁금합니다. 
저의 경우, 단순 visualizer 나 docking 계산등을 위해 사용 및 검토해본 제품입니다. 
1. pymol
2. Discovery Studio
3. Schrodinger
4. cresset - Flare
5. SYBIL
6. MOE

등입니다. 혹시 다른 제품이나 위에 제품을 사용하셔도 사용감이나 사용평을 답변 주시면 감사하겠습니다. 
  • 단백질 구조
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답변 1
  • 답변

    채종학님의 답변

    2020-06-08
    • 2
    안녕하세요
    국내 신약개발 분야에서는 Schrodinger 가 가장 많이 쓰이고 있는 것으로 알려져 있습니다. 
    그외 DiscoveryStudio, MOE 등이 있습니다. SYBYL은 이제 개발 종료되었고, Cresset 은 단백질 docking 분야는 이제 시작단계로 알고 있습니다.
    감사합니다
    답변수정
    안녕하세요
    국내 신약개발 분야에서는 Schrodinger 가 가장 많이 쓰이고 있는 것으로 알려져 있습니다. 
    그외 DiscoveryStudio, MOE 등이 있습니다. SYBYL은 이제 개발 종료되었고, Cresset 은 단백질 docking 분야는 이제 시작단계로 알고 있습니다.
    감사합니다
    양현모(yymomo) 2020-06-12

    답변 감사합니다.
    요즘 Cresset 의 Flare 제품을 확인 중에 있었습니다.
    그래도 Schrodinger 가 가장 범용적으로 쓰이는 군요.
    다시한번 감사드립니다.

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