지식나눔

DH5a competent cell 성능관련 질문

안녕하세요 
저는 DH5a를 이용하여 Heat shock  transforamtion을 하고 있습니다.
그런데 DH5a를 구매한 것을 불려서 사용하는데요
0.1M CaCl2를 이용하여 불리는 작업을 하였습니다.
그런데 성능이 불리기 전 구매한 DH5a보다 완전 떨어지는 것을 확인했습니다.
원인이 무엇인지 궁금합니다.
전문가 선생님들의 말씀부탁드립니다.
감사합니다.
  • DNA
  • transformation
  • DH5a
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각 분야 한인연구자와 현업 전문가분들의 답변을 기다립니다.
답변 5
  • 답변

    한민준님의 답변

    컴 셀 만들때 몇가지 유의사항이 있는데 아래와 같습니다. 

    1. 먼저 fresh한 competent cell을 사용해야 합니다. 
    LB (항생제 없는)에 streaking colony pick up하셔야 하구요
    2. 5-10mL start culture 하고 (overnight)
    3. 1L culture해서 OD가 0.4 되었을때 centrifuge해서 cell 얻어야 합니다. 
    4. 이 후 모든 작업은 ice에서 진행
    5. Aliquot 50-100 μL into sterile 1.5 mL (가끔 귀찮다고 1mL씩 aliquot해서 다시 사용하는 사람 있는데 한번 꺼낸 com cell은 다시 사용하면 절대 노 노...)

    이런 부분만 잘 지켜서 진행하면 꽤 좋은 com cell 만들어 사용할 수 있습니다. 
    전 이전에 site-directed mutagenesis시키는 것도 직접 만들어 사용했습니다..

     
    컴 셀 만들때 몇가지 유의사항이 있는데 아래와 같습니다. 

    1. 먼저 fresh한 competent cell을 사용해야 합니다. 
    LB (항생제 없는)에 streaking colony pick up하셔야 하구요
    2. 5-10mL start culture 하고 (overnight)
    3. 1L culture해서 OD가 0.4 되었을때 centrifuge해서 cell 얻어야 합니다. 
    4. 이 후 모든 작업은 ice에서 진행
    5. Aliquot 50-100 μL into sterile 1.5 mL (가끔 귀찮다고 1mL씩 aliquot해서 다시 사용하는 사람 있는데 한번 꺼낸 com cell은 다시 사용하면 절대 노 노...)

    이런 부분만 잘 지켜서 진행하면 꽤 좋은 com cell 만들어 사용할 수 있습니다. 
    전 이전에 site-directed mutagenesis시키는 것도 직접 만들어 사용했습니다..

     
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    장성재님의 답변

    제가 클로닝 입문하던 20여년 전에는 대부분의 랩에서 컴셀 stock을 1년에 한번씩 수백개 stock 만들어서 보관 후 사용했었는데 (물론 효율 테스트는 필수입니다), 최근에는 효율 좋은 제품 즉석에서 구매해서 많이들 사용하는 것 같던데....
    윗 분 말씀처럼 컴셀 제조법에도 다양한 레시피가 있으니, 본인의 레시피와 비교해 보시고 좋은 프로토콜을 재정립하시는 편이 좋을 것 같네요.
    제가 클로닝 입문하던 20여년 전에는 대부분의 랩에서 컴셀 stock을 1년에 한번씩 수백개 stock 만들어서 보관 후 사용했었는데 (물론 효율 테스트는 필수입니다), 최근에는 효율 좋은 제품 즉석에서 구매해서 많이들 사용하는 것 같던데....
    윗 분 말씀처럼 컴셀 제조법에도 다양한 레시피가 있으니, 본인의 레시피와 비교해 보시고 좋은 프로토콜을 재정립하시는 편이 좋을 것 같네요.
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    이평강님의 답변

    Hanahan method라고 MnCl2를 이용하여 하는 방법을 이용하시면 훨씬 높은 transformation 효율을 얻을 수 있습니다. Comp cell 자체 제작 시 세포가 굉장히 약하므로 vortex는 절대 하시면 안되구요 gentle하게 resuspension하는 과정이 번거롭지만 효율을 높입니다.
    Hanahan method라고 MnCl2를 이용하여 하는 방법을 이용하시면 훨씬 높은 transformation 효율을 얻을 수 있습니다. Comp cell 자체 제작 시 세포가 굉장히 약하므로 vortex는 절대 하시면 안되구요 gentle하게 resuspension하는 과정이 번거롭지만 효율을 높입니다.
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  • 답변

    이광호님의 답변

    저도 위에 분의 답변에 동의합니다.
    배우기도 그렇게 배웠고 실수로 진행해본 경험으로는 vortex나 tapping이나 이런 방법을 취하였을때 결과가 안좋았습니다.
    윗분 말씀대로 뭔가 손가락 스냅이나 이런것들일 이용해서 suspension 몇 번 정도만 하는것이 효율이 높았습니다.
    이런 기본적인 스킬이 아니라면. 아마 cell 자체에 문제가 왔을 거 같습니다. 가장 좋은 방법은 새로 구매해서 비교해보는 것이 시간과 고민을 줄일 수 있습니다. 구매회사를 바꾸는 것도 방법입니다.
    저도 위에 분의 답변에 동의합니다.
    배우기도 그렇게 배웠고 실수로 진행해본 경험으로는 vortex나 tapping이나 이런 방법을 취하였을때 결과가 안좋았습니다.
    윗분 말씀대로 뭔가 손가락 스냅이나 이런것들일 이용해서 suspension 몇 번 정도만 하는것이 효율이 높았습니다.
    이런 기본적인 스킬이 아니라면. 아마 cell 자체에 문제가 왔을 거 같습니다. 가장 좋은 방법은 새로 구매해서 비교해보는 것이 시간과 고민을 줄일 수 있습니다. 구매회사를 바꾸는 것도 방법입니다.
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    김정인님의 답변

    competent cell 을 만드는 방법에 있어서 차이가 나기 때문일 겁니다.
    엔지노믹스 competent cell과 비교했을 때 거의 같은 효율이 나오게 하는 방법이 (엔지노믹스에서는 어떤 방법을 사용하는지 모릅니다.) Inoue method 입니다. 워낙에 효율이 좋아서 supercompetent cell 만드는 방법으로 알려져 있습니다.
     
    competent cell 을 만드는 방법에 있어서 차이가 나기 때문일 겁니다.
    엔지노믹스 competent cell과 비교했을 때 거의 같은 효율이 나오게 하는 방법이 (엔지노믹스에서는 어떤 방법을 사용하는지 모릅니다.) Inoue method 입니다. 워낙에 효율이 좋아서 supercompetent cell 만드는 방법으로 알려져 있습니다.
     
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