2023-12-31
org.kosen.entty.User@171d8dfa
익명
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논문에 있는 heatmap figure를 보다가 도저히 이해가 안되는 부분이 있습니다.
색으로 구분해서 control대비 실험군에서 gene의 발현률이 증가하거나 감소한 것을 나타낸건 알겠는데
그 heatmap 그래프에서 위쪽이랑 옆 쪽에 있는 선 같은게 어떤걸 의미하는지 모르겠습니다.
실험군 1이랑 2랑 연결해 놓은 선을 실험군 3이랑 연결하고 또 그걸 control이랑 연결한다거나
A라는 gene이랑 B랑 연결해 놓고 그걸 또 C라는 gene이랑 연결해 놓고...
마치 가계도 처럼 해놓았는데 그게 어떤걸 의미하는 건가요?
- Sequencing
- Heatmap
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한민준님의 답변
2023-12-31- 1
정확한 그림이 없어서 확실하지는 않지만
일반적으로는 특정 유전자들이 각 그룹간에서 얼마나 비슷하게 (up-regulation/down-regulation) expression이 되는지를 나타냅니다.
x축은 샘플
y축은 유전자
이렇게 해서 cluster를 만들면 control과 비교해서 실험군에서 차이가 나게 유전자 발현이 되는 cluster가생기게 되고 이것을 이용해서 어떠한 유전자들이 특정 환경(질환)에 대해서 발현이 되는지를 한 눈에 확인 할 수 있게 보여주게 됩니다.