지식나눔

간 조직을 H&E 염색하여 lipid droplet 통계방법

R과 같은 프로그램을 사용해서 manual로 분석하지 않고 automation으로 구현하는 방법 알려주시면 감사하겠습니다. 

지식의 출발은 질문, 모든 지식의 완성은 답변! 
각 분야 한인연구자와 현업 전문가분들의 답변을 기다립니다.
답변 2
  • 답변

    이병진님의 답변

    안녕하세요,


    이미지로부터 통계처리까지를 자동화하고싶으신건지 아니면 통계분석만 이야기하시는건지 명확하지 않은 것 같습니다.

    후자라면 아래 유튜브 링크를 참고하시면서 따라해보시면 좋을 것 같네요.

    https://www.youtube.com/watch?v=UBopyjT39rY&ab_channel=RiffomonasProject


    전자라면, Python 및 기타 라이브러리를 활용하여 스크립트를 짤 수 있을 것 같습니다만, 초보자이신 경우에는 이미지분석은 ImageJ를 통해서 분석하고 얻은 결과를 통계처리하는 방법이 더 효율적일 수도 있을 것 같습니다.

    안녕하세요,


    이미지로부터 통계처리까지를 자동화하고싶으신건지 아니면 통계분석만 이야기하시는건지 명확하지 않은 것 같습니다.

    후자라면 아래 유튜브 링크를 참고하시면서 따라해보시면 좋을 것 같네요.

    https://www.youtube.com/watch?v=UBopyjT39rY&ab_channel=RiffomonasProject


    전자라면, Python 및 기타 라이브러리를 활용하여 스크립트를 짤 수 있을 것 같습니다만, 초보자이신 경우에는 이미지분석은 ImageJ를 통해서 분석하고 얻은 결과를 통계처리하는 방법이 더 효율적일 수도 있을 것 같습니다.

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  • 답변

    장성재님의 답변

    예전에는 NIH에서 제공하는 무료 프로그램인 Image J(NIH Image)를 많이 썼던 것 같은데요.


    비교적 사용법이 간단하고 이미지의 정량화에 많이 사용했던 거 같네요.


    https://imagej.net/nih-image/

    https://imagej.net/ij/


    보통 실험을 통해 얻은 이미지의 영상 처리는 위에서 소개해 드린  Image J 등 이미지 처리 프로그램을 사용하여 이미지 상의 특정 색깔의 단위 면적 당 pixel 수 및 intensity를 정량화한  수치를 얻은 후(data aquisition)에 정량화 수치에 대하여 R program 또는 기타 통계 프로그램을 활용하여 통계적인 처리를 하는 과정을 거칩니다.  참고하세요.

    예전에는 NIH에서 제공하는 무료 프로그램인 Image J(NIH Image)를 많이 썼던 것 같은데요.


    비교적 사용법이 간단하고 이미지의 정량화에 많이 사용했던 거 같네요.


    https://imagej.net/nih-image/

    https://imagej.net/ij/


    보통 실험을 통해 얻은 이미지의 영상 처리는 위에서 소개해 드린  Image J 등 이미지 처리 프로그램을 사용하여 이미지 상의 특정 색깔의 단위 면적 당 pixel 수 및 intensity를 정량화한  수치를 얻은 후(data aquisition)에 정량화 수치에 대하여 R program 또는 기타 통계 프로그램을 활용하여 통계적인 처리를 하는 과정을 거칩니다.  참고하세요.

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