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Western blot할 때 cell에 따른 antibody 반응성 차이

BMDM에서 endogenous protein을 보려고 항체를 샀습니다.

구매한 항체로 Western blot 조건을 잡으려고 BMDM에서 protein을 prep해서 하지 않고

일단 해당 protein을 293T cell에서 over-expression 시킨 후 protein prep해서 positive control로 사용했습니다.

Detection이 잘 되는 조건을 잡은 후, BMDM에서  protein prep 후 동일한 조건으로 western blot을 했습니다.

Western blot할 때 해당 protein을 over-expression한 293T protein도 같이 gel에 걸어서 진행했는데

293T 에선 band가 detection 됐는데, BMDM에선 band가 하나도 detection되지 않았습니다.


동일한 항체라도 cell 종류에 따라서 사용이 가능할 수도 있고 안 될 수도 있다고 얼핏 본 것 같은데 그런 경우 일까요?

이런 경우에는 어디서 부터 문제를 해결해야 할까요?

  • western blot
  • antibody
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답변 1
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    한민준님의 답변

    BMDM cell에서 target으로 하는 protein의 endogenous level이 낮거나 없을 수 있습니다. 

    같은 human이라고 해도 모든 protein이 같은 level로 expression하지는 않습니다. 

    BMDM cell에서 target으로 하는 protein의 endogenous level이 낮거나 없을 수 있습니다. 

    같은 human이라고 해도 모든 protein이 같은 level로 expression하지는 않습니다. 

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