지식나눔

KO mouse에서 해당 gene의 protein 발현

제가 관심있는 유전자를 KO시킨 마우스에서 BMM을 prep한 후 protein이 발현 되는지 WB으로 확인하고 있습니다.

이 gene은 exon이 2개 인데 exon2를 완전히 다 제거했고 exon1은 남아 있는 상태입니다.

마우스 조직을 사용한 genotyping과 BMM을 사용한 qPCR을 통해 DNA, RNA 수준에서 완벽하게 KO된 것을 확인했습니다.

그런데 protein 발현 수준을 WB로 확인하면 꼭 detection됩니다.

항체 문제인가 싶어서 항체를 바꿔봤는데도 똑같이 detection됩니다.

WT에 뜨는건 맞는데 왜 KO에서 WT에서 뜨는 밴드와 완전 똑같은 위치에 detection되는지 이해가 되질 않습니다.


혹시 이런 경우가 있으셨던 분 계실까요?



  • Knock out
  • protein
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답변 1
  • 답변

    김헌성님의 답변

    안녕하세요

    knock out은 원래 유전자가 제가 되는 것이 맞는데요 knock down 처럼

    유전자가 불활성화 되는 경우도 있어서 WB를 했을때 나타나는 경우도 있습니다.

    또는 정확히 확인하지 않은 이상 knock out mouse가 아닌 경우도 있습니다. 

    이런 경우 PCR을 돌려 보시거나 구입하신 업체와 상의 해보시는 것도 괜찮습니다.

    감사합니다.

    안녕하세요

    knock out은 원래 유전자가 제가 되는 것이 맞는데요 knock down 처럼

    유전자가 불활성화 되는 경우도 있어서 WB를 했을때 나타나는 경우도 있습니다.

    또는 정확히 확인하지 않은 이상 knock out mouse가 아닌 경우도 있습니다. 

    이런 경우 PCR을 돌려 보시거나 구입하신 업체와 상의 해보시는 것도 괜찮습니다.

    감사합니다.

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