지식나눔

KO mouse에서 protein detection

Target gene이 exon이 2개인데 두 번째 exon을 모두 KO하고, 첫 번째 exon은 남긴 KO mouse를 제작했습니다.

남은 첫 번째 exon의 base는 21개 정도로 매우 짧습니다.

Target gene은 특정 염증 상황에서 RNA 및 protein발현이 증가하여서

WT과 KO mouse의 primary cell을 prep하여 target gene을 induction시킨 다음 qPCR과 WB으로 확인했습니다.

(실험 전 genotyping으로 KO된 것을 확인했습니다.)


qPCR 결과, WT에선 induction하지 않으면 target gene의 RNA 발현이  없었는데 induction 했을 경우 발현이 매우 높게 증가했으며

KO에선 induction 유무와 상관 없이 RNA  발현 자체가 없는 것을 확인했습니다. 


그런데 WB에서 보면, WT mouse에서 induction하지 않은 sample에서 band가 나왔고, 

induction하면 더 진한 band가 나오긴 했습니다.

KO mouse에선 target gene을 induction하던 하지 않던 protein이 detection되지 않아야 하는데 모두 band가 나왔습니다.


이런 경우 antibody의 cross reactivity 때문일까요? 혹은 다른 문제가 있는 걸까요?




  • KO mouse
지식의 출발은 질문, 모든 지식의 완성은 답변! 
각 분야 한인연구자와 현업 전문가분들의 답변을 기다립니다.
답변 0