2013-06-07
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황윤영(yyhwang)
새로운 저장장치를 위한 차세대 데이터베이스 시스템: 플래시 메모리, 플래시 기반 SSD, DDR RAM 기반 SSD, NVRAM 기반 SSD 모두를 포괄하는 차세대 저장장치의 경우 기존 하드디스크와는 많은 저장장치로서의 차이점이 있다. 이러한 차이점으로 인해 기존에 하드 디스크에 최적화된 기존의 데이터베이스 시스템에서 최적화된 성능을 보이지 못하게 된다. 데이터베이스 시스템을 새로운 저장장치들에 맞게 최적화하기 위한 연구를 수행,유전체 시퀀스 조립 및 분석에 대한 연구 유전체(DNA)는 A,C,G,T의 4개의 문자로 구성된 시퀀스이다. 이러한 시퀀스는 생물정보학의 가장 기본적인 데이터이다. 하지만 서열화 가능한 유전체의 길이가 수백 bp(base pair)에 불과해 전체 유전체를 서열을 판독하기 위해서는 시퀀스 조립을 위한 알고리즘이 개발되어야 한다. 또한 유전체의 SNP, Polymorphism, Gene등의 정보를 분석하기 위해 유전체의 부가적인 정보를 분석할 수 있는 기술 역시 개발되어야 한다. Computational Functional Genomics(CFG) 생물의 모든 유전자 정보 및 유전체 다형성 정보의 양은 엄청나며, 생물학적인 실험만으로 그 기능을 추론하려면 엄청난 시간과 노력이 따른다. 이와 같은 생물학적 난점을 컴퓨터 알고리즘을 통해서 해결하고자 하는 것이 Computational Functional Genomics이다.*새로운 저장장치를 위한 차세대 데이터베이스 시스템 플래시 메모리, 플래시 기반 SSD, DDR RAM 기반 SSD, NVRAM 기반 SSD 모두를 포괄하는 차세대 저장장치의 경우 기존 하드디스크와는 많은 저장장치로서의 차이점이 있다. 이러한 차이점으로 인해 기존에 하드 디스크에 최적화된 기존의 데이터베이스 시스템에서 최적화된 성능을 보이지 못하게 된다. 데이터베이스 시스템을 새로운 저장장치들에 맞게 최적화하기 위한 연구를 수행한다.
#Bioinformatics #Database System #Secure Data and Content Managemetn
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