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지식나눔

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Gramicidin A channel 에 대해 알고 싶습니다.

2004-10-16 org.kosen.entty.User@cda7f8 박진우(jinu1115)
  • 2
논문 몇 편 보긴 했는데, 그래도 이곳의 도움을 받으면 더 좋을 것 같아서요. 박테리아가 분비하는 이온 채널로 알고 있습니다. 1가 양이온(주로 proton)들만 선택적으로 통과시키구요... 그런데 구조를 보니깐 환경에 따라 다른 것 같은데... β-helix 라는 말도 나오고, 두 나선이 꼬여있기도 하고, head-to-head로 이루어졌다고도 하고... gramicidin 에 대해 잘 알고 계신 분이나 좋은 참고자료 알고 계신 분들께 조언을 부탁합니다.
  • ion channel
  • gramicidin
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답변 2
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    강형석님의 답변

    2004-10-16
    • 0

    첨부파일

    >논문 몇 편 보긴 했는데, 그래도 이곳의 도움을 받으면 더 좋을 것 같아서요. > >박테리아가 분비하는 이온 채널로 알고 있습니다. > >1가 양이온(주로 proton)들만 선택적으로 통과시키구요... > >그런데 구조를 보니깐 환경에 따라 다른 것 같은데... > >β-helix 라는 말도 나오고, 두 나선이 꼬여있기도 하고, head-to-head로 이루어졌다고도 하고... > >gramicidin 에 대해 잘 알고 계신 분이나 좋은 참고자료 알고 계신 분들께 조언을 부탁합니다. gramicidin은 A, B, C type이 있는데 보통 3 type의 혼합물로 존재하지만 A가 가장 많아서 보통 gramicidin이라고 하면 A type 또는 혼합물의 통칭으로 D type을 의미합니다. gramicidin은 아미노산 시퀀스가 거의 소수성 아미노산만 존재해서 펩타이드 전체가 아주 소수성 성질을 가지고 있는데다가, 스스로 전하를 가지고 있지 않습니다. 이런 이유로 당연히 막단백질로 존재할 수 밖에 없고, 막단백질에서 존재할 때는 지질막을 통한 이온의 투과에 관계합니다. gramicidin은 두개의 펩타이드가 N-terminal과 C-terminal의 방향이 서로 반대방향이면서 서로 helcal 형태로 존재하는 double helical 구조와, N-terminal이 서로 마주보면서 helix로 형태로 존재하는 helical dimer가 있습니다. 보통 전자를 pore라고 부르고 후자를 channel이라고 부르는데, 어쨌든 helix의 바깥쪽으로는 소수기들이 위치하고 안쪽은 이온들이 바인딩할 수있는 친수기들이 존재해서, 소수기들은 지질막에 바인딩하고 이온들은 helix 안쪽을 통해 투과한다고 합니다. 물론 이온의 투과는 펩타이드 구조가 지질막내에서 변화됨으로서 이루어지죠. 자세한 건 첨부하는 논문에 잘 설명되어 있으니 참조하시기 바랍니다.
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    >논문 몇 편 보긴 했는데, 그래도 이곳의 도움을 받으면 더 좋을 것 같아서요. > >박테리아가 분비하는 이온 채널로 알고 있습니다. > >1가 양이온(주로 proton)들만 선택적으로 통과시키구요... > >그런데 구조를 보니깐 환경에 따라 다른 것 같은데... > >β-helix 라는 말도 나오고, 두 나선이 꼬여있기도 하고, head-to-head로 이루어졌다고도 하고... > >gramicidin 에 대해 잘 알고 계신 분이나 좋은 참고자료 알고 계신 분들께 조언을 부탁합니다. gramicidin은 A, B, C type이 있는데 보통 3 type의 혼합물로 존재하지만 A가 가장 많아서 보통 gramicidin이라고 하면 A type 또는 혼합물의 통칭으로 D type을 의미합니다. gramicidin은 아미노산 시퀀스가 거의 소수성 아미노산만 존재해서 펩타이드 전체가 아주 소수성 성질을 가지고 있는데다가, 스스로 전하를 가지고 있지 않습니다. 이런 이유로 당연히 막단백질로 존재할 수 밖에 없고, 막단백질에서 존재할 때는 지질막을 통한 이온의 투과에 관계합니다. gramicidin은 두개의 펩타이드가 N-terminal과 C-terminal의 방향이 서로 반대방향이면서 서로 helcal 형태로 존재하는 double helical 구조와, N-terminal이 서로 마주보면서 helix로 형태로 존재하는 helical dimer가 있습니다. 보통 전자를 pore라고 부르고 후자를 channel이라고 부르는데, 어쨌든 helix의 바깥쪽으로는 소수기들이 위치하고 안쪽은 이온들이 바인딩할 수있는 친수기들이 존재해서, 소수기들은 지질막에 바인딩하고 이온들은 helix 안쪽을 통해 투과한다고 합니다. 물론 이온의 투과는 펩타이드 구조가 지질막내에서 변화됨으로서 이루어지죠. 자세한 건 첨부하는 논문에 잘 설명되어 있으니 참조하시기 바랍니다.
    등록된 댓글이 없습니다.
  • 답변

    신정규님의 답변

    2004-10-17
    • 0
    다음 논문 참조하시기 바랍니다. 제 목 Organization of the biosynthesis genes for the peptide antibiotic gramicidin S. 저 자 Krause, M, Marahiel, MA 발행기관 American Society for Microbiology 발행정보 Journal of bacteriology, 170권, 10호, 6쪽, 1988년 제 목 Gramicidin K, a new linear channel-forming gramicidin from Bacillus brevis . 저 자 Koeppe, RE II, Paczkowski, JA, Whaley, WL 발행기관 American Chemical Society 발행정보 Biochemistry, 24권, 12호, 15쪽, 1985년 제 목 Molecular dynamics simulation of the gramicidin channel in a phospholipid bilayer 저 자 Woolf, TB, Roux, B* 발행기관 National Academy of Sciences 발행정보 Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America., 91권, 24호, 5쪽, 1994년 제 목 Dynamic properties of gramicidin A in phospholipid membranes. 저 자 Macdonald, PM, Seelig, J 발행기관 American Chemical Society 발행정보 Biochemistry, 27권, 7호, 8쪽, 1988년 >논문 몇 편 보긴 했는데, 그래도 이곳의 도움을 받으면 더 좋을 것 같아서요. > >박테리아가 분비하는 이온 채널로 알고 있습니다. > >1가 양이온(주로 proton)들만 선택적으로 통과시키구요... > >그런데 구조를 보니깐 환경에 따라 다른 것 같은데... > >β-helix 라는 말도 나오고, 두 나선이 꼬여있기도 하고, head-to-head로 이루어졌다고도 하고... > >gramicidin 에 대해 잘 알고 계신 분이나 좋은 참고자료 알고 계신 분들께 조언을 부탁합니다.
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    다음 논문 참조하시기 바랍니다. 제 목 Organization of the biosynthesis genes for the peptide antibiotic gramicidin S. 저 자 Krause, M, Marahiel, MA 발행기관 American Society for Microbiology 발행정보 Journal of bacteriology, 170권, 10호, 6쪽, 1988년 제 목 Gramicidin K, a new linear channel-forming gramicidin from Bacillus brevis . 저 자 Koeppe, RE II, Paczkowski, JA, Whaley, WL 발행기관 American Chemical Society 발행정보 Biochemistry, 24권, 12호, 15쪽, 1985년 제 목 Molecular dynamics simulation of the gramicidin channel in a phospholipid bilayer 저 자 Woolf, TB, Roux, B* 발행기관 National Academy of Sciences 발행정보 Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America., 91권, 24호, 5쪽, 1994년 제 목 Dynamic properties of gramicidin A in phospholipid membranes. 저 자 Macdonald, PM, Seelig, J 발행기관 American Chemical Society 발행정보 Biochemistry, 27권, 7호, 8쪽, 1988년 >논문 몇 편 보긴 했는데, 그래도 이곳의 도움을 받으면 더 좋을 것 같아서요. > >박테리아가 분비하는 이온 채널로 알고 있습니다. > >1가 양이온(주로 proton)들만 선택적으로 통과시키구요... > >그런데 구조를 보니깐 환경에 따라 다른 것 같은데... > >β-helix 라는 말도 나오고, 두 나선이 꼬여있기도 하고, head-to-head로 이루어졌다고도 하고... > >gramicidin 에 대해 잘 알고 계신 분이나 좋은 참고자료 알고 계신 분들께 조언을 부탁합니다.
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