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지식나눔

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streptavidin이 무엇인가요? microscopic microspot?

2005-04-16 org.kosen.entty.User@2c9140d0 조상은(aniel)
  • 2
streptavidin-coated paramagnetic material which were deposited as microscopic microspots on hydrophobic surface. 란 말이 나오는데요. 여기서 streptavidin 이 무엇인지 아시는분 계시나요?모르겠어서요. 또한 microscopic microspots 이란말은 hydrophobic 한 표면위에 마이크로단위로 흡착시켰다 라고 보면 될까요?
  • streptavidin
  • microscopic microspots
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답변 2
  • 답변

    신정규님의 답변

    2005-04-16
    • 0

    첨부파일

    >streptavidin-coated paramagnetic material which were deposited as microscopic microspots on hydrophobic surface. 란 말이 나오는데요. > >여기서 streptavidin 이 무엇인지 아시는분 계시나요?모르겠어서요. > >또한 microscopic microspots 이란말은 hydrophobic 한 표면위에 마이크로단위로 흡착시켰다 라고 보면 될까요? > > Sterptvidin자료를 첨부해 드립니다. 그리고 microscopic microspot에 대한 정확한 의미는 잘 모르겠네요...논문을 읽어봐야 할 것 같은데..(시간 부족으로 인하여..죄송.) 다음 논문에 관련된 것이 나오는 듯..^^ title : Monitoring beta-galactosidase activity by means of scanning electrochemical microscopy source : Journal of Electroanalytical Chemistry, 561(1-2), pp.83-91, 2004 author : Zhao C, Sinha JK, Wijayawardhana CA, Wittstock G
    답변수정
    >streptavidin-coated paramagnetic material which were deposited as microscopic microspots on hydrophobic surface. 란 말이 나오는데요. > >여기서 streptavidin 이 무엇인지 아시는분 계시나요?모르겠어서요. > >또한 microscopic microspots 이란말은 hydrophobic 한 표면위에 마이크로단위로 흡착시켰다 라고 보면 될까요? > > Sterptvidin자료를 첨부해 드립니다. 그리고 microscopic microspot에 대한 정확한 의미는 잘 모르겠네요...논문을 읽어봐야 할 것 같은데..(시간 부족으로 인하여..죄송.) 다음 논문에 관련된 것이 나오는 듯..^^ title : Monitoring beta-galactosidase activity by means of scanning electrochemical microscopy source : Journal of Electroanalytical Chemistry, 561(1-2), pp.83-91, 2004 author : Zhao C, Sinha JK, Wijayawardhana CA, Wittstock G
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  • 답변

    전주홍님의 답변

    2005-04-17
    • 0
    Avidin-biotin system은 purification, diagnosis, detection, interaction 등 biotechnology 분야에서 빼 놓을 수 없을 정도로 광범위하게 사용되고 있습니다. 가장 근간이 되는 특징은 두 분자사이의 친화력에 있습니다. 해리 상수가 10^15 승으로 자연계에 존재하는 생명분자의 비공유결합 중에서 가장 해리상수가 낮은 것으로 잘알려져 있습니다. 최초 avidin에서 부터 출발하였지만 단점이 많아서 이와 거의 흡사한 특성을 지닌 단백질인 streptavidin이 각광을 받게 되었고 이어 재조합 기법으을 사용한 단백질을 생산하면서 streptavidin의 단점을 보완한 형태도 나오게 되었습니다. Avidin과 Streptavidin에 대해서 짧게 설명드리면, 1. Avidin 1) 조류, 파충류, 양서류의 조직이나 white egg (계란 흰자가 유명하죠)에서 발견되는 당단백질 입니다. 2) 4 개의 동일한 subunit로 구성되며, one subunit와 one biotin이 결합하게 됩니다. 3) 분자량은 67,000 - 68,000 정도이면 이중 당이 차지하는 비율은 총 분자량 중 10% 됩니다. 4) 128 a.a로 구성되며, pI = 10 - 10.5를 나타내고 있습니다. pI 값이 높고 당성분이 있어 비특이적 결합도 많이 발생합니다. 2. Streptavidin 1) Streptomyces avidinii에서 유래한 단백질입니다. 2) 당이 붙어 있지 않습니다. 3) avidin과 동일하게 4 개의 동일한 subunit로 구성 (tetramer)되며, one subunit와 one biotin이 결합하게 됩니다. 5) 분자량은 60,000 (14.000/one subunit) 입니다 6) pI = 5 Streptavidin은 당을 포함하지 않아 상당히 비특이적 결합이 상당히 줄어들었습니다. 그러나, streptavidin은 Arg-Tyr-Asp (RYD) 서열을 가지고 있는데 이는 cell adhesion motif인 RGD가 유사하여 세포 표면에 비특이적으로 결합하는 특성을 가지고 있습니다. 이러한 단점을 보완하기 위해 RYD 서열을 재조합 기술로 변이를 시켜 비특이적 결합의 단점을 극복하였는데 이들이 바로 Neutravidin (Pierce)과 Extravidin (Sigma)입니다. 참고로 biotin은 많은 저분자물질에도 용이하게 conjugation 시킬 수 있고 단백질 labeling하는 무수한 방법이 있고 또한 많이 사용됩니다. 그러므로 streptavidin-biotin system은 capture 방법을 근간으로 바이오 산업에 많이 응용되고 있습니다.
    답변수정
    Avidin-biotin system은 purification, diagnosis, detection, interaction 등 biotechnology 분야에서 빼 놓을 수 없을 정도로 광범위하게 사용되고 있습니다. 가장 근간이 되는 특징은 두 분자사이의 친화력에 있습니다. 해리 상수가 10^15 승으로 자연계에 존재하는 생명분자의 비공유결합 중에서 가장 해리상수가 낮은 것으로 잘알려져 있습니다. 최초 avidin에서 부터 출발하였지만 단점이 많아서 이와 거의 흡사한 특성을 지닌 단백질인 streptavidin이 각광을 받게 되었고 이어 재조합 기법으을 사용한 단백질을 생산하면서 streptavidin의 단점을 보완한 형태도 나오게 되었습니다. Avidin과 Streptavidin에 대해서 짧게 설명드리면, 1. Avidin 1) 조류, 파충류, 양서류의 조직이나 white egg (계란 흰자가 유명하죠)에서 발견되는 당단백질 입니다. 2) 4 개의 동일한 subunit로 구성되며, one subunit와 one biotin이 결합하게 됩니다. 3) 분자량은 67,000 - 68,000 정도이면 이중 당이 차지하는 비율은 총 분자량 중 10% 됩니다. 4) 128 a.a로 구성되며, pI = 10 - 10.5를 나타내고 있습니다. pI 값이 높고 당성분이 있어 비특이적 결합도 많이 발생합니다. 2. Streptavidin 1) Streptomyces avidinii에서 유래한 단백질입니다. 2) 당이 붙어 있지 않습니다. 3) avidin과 동일하게 4 개의 동일한 subunit로 구성 (tetramer)되며, one subunit와 one biotin이 결합하게 됩니다. 5) 분자량은 60,000 (14.000/one subunit) 입니다 6) pI = 5 Streptavidin은 당을 포함하지 않아 상당히 비특이적 결합이 상당히 줄어들었습니다. 그러나, streptavidin은 Arg-Tyr-Asp (RYD) 서열을 가지고 있는데 이는 cell adhesion motif인 RGD가 유사하여 세포 표면에 비특이적으로 결합하는 특성을 가지고 있습니다. 이러한 단점을 보완하기 위해 RYD 서열을 재조합 기술로 변이를 시켜 비특이적 결합의 단점을 극복하였는데 이들이 바로 Neutravidin (Pierce)과 Extravidin (Sigma)입니다. 참고로 biotin은 많은 저분자물질에도 용이하게 conjugation 시킬 수 있고 단백질 labeling하는 무수한 방법이 있고 또한 많이 사용됩니다. 그러므로 streptavidin-biotin system은 capture 방법을 근간으로 바이오 산업에 많이 응용되고 있습니다.
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