지식나눔

peptide서열의 상동성 분석 방법이 궁금 합니다.

peptide의 상동성을 알고 싶은데 상동성 알아보는 프로그램이나 방법 알고 있으면 좀 가르쳐 주세요 꼭 부탁합니다.~~~~
  • peptide
  • sequence
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답변 3
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    임채진님의 답변

    >peptide의 상동성을 알고 싶은데 상동성 알아보는 프로그램이나 방법 알고 있으면 좀 가르쳐 주세요 꼭 부탁합니다.~~~~ ClustalW site를 이용해도 좋답니다. http://www.ebi.ac.uk/clustalw/ 본 사이트에서 내용 넣는 란에 > A단백질 이름 서열 > B단백질 이름 서열 . . . 이렇게 작성하고 run하시면 결과 나온답니다.. 적는 사이에 다른분이 적으셨군요..^^ 삭제가 안돼서... 죄송합니다..^^;;
    >peptide의 상동성을 알고 싶은데 상동성 알아보는 프로그램이나 방법 알고 있으면 좀 가르쳐 주세요 꼭 부탁합니다.~~~~ ClustalW site를 이용해도 좋답니다. http://www.ebi.ac.uk/clustalw/ 본 사이트에서 내용 넣는 란에 > A단백질 이름 서열 > B단백질 이름 서열 . . . 이렇게 작성하고 run하시면 결과 나온답니다.. 적는 사이에 다른분이 적으셨군요..^^ 삭제가 안돼서... 죄송합니다..^^;;
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    김정민님의 답변

    http://www.ebi.ac.uk/clustalw/ 에서 상호 비교할 수 있습니다. 방법은, >이름 sequences >이름2 sequences 2 . . . 으로 입력하면 되며, 주의사항으로는 '>' 표시는 이름앞에 항상 있어야 하며, enter 후, sequences를 복사하여 삽입하면 됩니다. 이때 숫자 등이 포함되어 있어도 무방합니다. 다양한 방법을 직접 실행하여 보세요. >peptide의 상동성을 알고 싶은데 상동성 알아보는 프로그램이나 방법 알고 있으면 좀 가르쳐 주세요 꼭 부탁합니다.~~~~
    http://www.ebi.ac.uk/clustalw/ 에서 상호 비교할 수 있습니다. 방법은, >이름 sequences >이름2 sequences 2 . . . 으로 입력하면 되며, 주의사항으로는 '>' 표시는 이름앞에 항상 있어야 하며, enter 후, sequences를 복사하여 삽입하면 됩니다. 이때 숫자 등이 포함되어 있어도 무방합니다. 다양한 방법을 직접 실행하여 보세요. >peptide의 상동성을 알고 싶은데 상동성 알아보는 프로그램이나 방법 알고 있으면 좀 가르쳐 주세요 꼭 부탁합니다.~~~~
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    전주홍님의 답변

    ExPASy (Expert Protein Analysis System) (www.expasy.org)에서 해결할 수 있을 것 같은데요... Expasy에서 Tools and software packages를 보시면 Similarity searches [BLAST]가 있는데 여기를 클릭해서 들어가면 여러가지 프로그램을 활용할 수 있습니다. 주로 peptide 서열을 입력한 후 상동성을 가진 peptide를 확인할 수 있습니다. 알고 있는 서열의 상동성 또는 유사성 비교는 역시 Tools and software packages에 있는 Alignment [T-COFFEE, SIM]를 클릭하면 역시 여러가지 프로그램을 활용할 수 있는데 주로 두가지 또는 그 이상의 서열을 입력 후에 비교할 수 있습니다. >peptide의 상동성을 알고 싶은데 상동성 알아보는 프로그램이나 방법 알고 있으면 좀 가르쳐 주세요 꼭 부탁합니다.~~~~
    ExPASy (Expert Protein Analysis System) (www.expasy.org)에서 해결할 수 있을 것 같은데요... Expasy에서 Tools and software packages를 보시면 Similarity searches [BLAST]가 있는데 여기를 클릭해서 들어가면 여러가지 프로그램을 활용할 수 있습니다. 주로 peptide 서열을 입력한 후 상동성을 가진 peptide를 확인할 수 있습니다. 알고 있는 서열의 상동성 또는 유사성 비교는 역시 Tools and software packages에 있는 Alignment [T-COFFEE, SIM]를 클릭하면 역시 여러가지 프로그램을 활용할 수 있는데 주로 두가지 또는 그 이상의 서열을 입력 후에 비교할 수 있습니다. >peptide의 상동성을 알고 싶은데 상동성 알아보는 프로그램이나 방법 알고 있으면 좀 가르쳐 주세요 꼭 부탁합니다.~~~~
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