2005-11-07
org.kosen.entty.User@50a077ef
표재훈(ahrehd78)
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GTPase activating protein을 가지고 실험하고 있는데요
이것의 function을 알고자 constitutive active form과
dominant negative form의 construct을 만들어야 합니다.
문제는 어느 amino acid를 mutation시켜야 하는지를 모르고 있다는 점입니다.
논문을 찾아봐도 "이 부분을 이렇게 muation시켰다" 정도 밖에 없고
그 부분을 어떻게 찾아내었는지에 대한 설명이 나와있는 곳이 없더군요.
여러분.. 좀 도와주십시오.. 훌쩍..
- constitutive active
- dominant negative
- mutagenesis
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각 분야 한인연구자와 현업 전문가분들의 답변을 기다립니다.
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답변 1
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답변
전주홍님의 답변
2005-11-11- 0
첫번째는 genetic study로 부터 힌트를 얻을 수 있습니다. oncogene들의 경우 mutation에 의해 활성이 항상 나타나는 경우가 많죠... 이런 mutation을 인위적으로 만들면 constitutive active form을 얻들 수 있습니다. 만약 mutation에 의해 기능이 상실된다면 반대로 dominant negative form을 얻을 수 있습니다. 두번째는 rationale-based approach입니다. 효소의 경우 active site나 substrate binding site에 대한 생화학적 지식이 축적되면 이를 변이를 시키면서 확인할 수 있습니다. 또한 구조적 지식이 축적되면 어떤 residue가 구조변화에 중요한지 등을 알 수 있기 때문에 이를 이용하여 mutation을 만들고 확인을 할 수 있습니다. 세번째는 선행연구를 이용하는 방법입니다. homologous protein을 이용한 선례가 있다면 이를 이용하여 비슷한 위치에 변이를 유도할 수 있습니다. 이런저런 정보가 없다면 하나의 큰 연구과제가 되겠지요...즉 1차 구조와 기능과의 관련성을 연구해야 되고 이를 기반으로 원하는 기능이 나타나는 mutant construct를 제작해야겠지요... >GTPase activating protein을 가지고 실험하고 있는데요 >이것의 function을 알고자 constitutive active form과 >dominant negative form의 construct을 만들어야 합니다. >문제는 어느 amino acid를 mutation시켜야 하는지를 모르고 있다는 점입니다. >논문을 찾아봐도 “이 부분을 이렇게 muation시켰다“ 정도 밖에 없고 >그 부분을 어떻게 찾아내었는지에 대한 설명이 나와있는 곳이 없더군요. > >여러분.. 좀 도와주십시오.. 훌쩍..