2006-01-04
org.kosen.entty.User@41552b29
구광본(kkb418)
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안녕하세요.
Differential Display 관련해서
Seegene의 DEG 와 GenHunter DD-PCR 회사제품에..
여러 종류의 kit이 있더군요..
이두회사의 제품을 사용할때..Kit이외에 다른 필요한 kit이나.시약등 필요로하는것이 무엇인지요..
제가 정확한 정의가 내려지지 않아...사용하신 제품에대한 상세설명부탁드립니다...(제품번호..등등).
그리고 Genhunter제품중에 RNAmap과 RNAimage kit 차이점은 무엇인가요..
경제적으로 유리한 제품은 어떤것인지도 부탁드립니다.
답변부탁드립니다..
감사합니다.
- DEG
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답변 1
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답변
김성환님의 답변
2006-01-04- 0
Seegene의 장점 1. Service가 된다 (연구비가 넉넉하시면 실험을 의뢰할 수도 있다) 2. isotope을 사용하지 않고 agarose gel상에서 발현이 다른 유전자를 꺼내서 cloning을 할 수 있다. 3. Agarose를 사용하기때문에 샘플간의 차이를 빠르게 볼 수 있다. (or 볼 수만 있다.) Seegene의 단점 1. ACP primer가 120여종 있는 것으로 알고 있는데 이것으로는 mRNA를 30%밖에 cover하지 못한다고 세미나때 발표함. 2. Agarose에서 유전자를 cutting하여 cloning하는 기술이라 false나 있을 수도 있으며 다른 유전자와 섞여서 나올 수 도 있다. 즉 resolution이 낮다고 할 수 있음. Genhunter(RNAimage)의 장점 1. AP(arbitary primer)와 one base-anchored oligodT primer의 combination으로 mRNA를 90%이상 cover할 수 있다고 수학적으로 계산되어 있다. 2. polyacryamide gel(sequencing gel)을 사용하기 때문에 gene to gene의 resolution이 좋다. 3. 경험상으로 false가 seegene것 보다는 적다. Genehunter의 단점 1. radioisotope을 사용하여야 한다. 2. polyacryamide gel(sequencing gel)을 만들어 샘플을 로딩해야 하고 이후 3M paper에 붙여 dry하고 expose하는데도 시간이 1주일 정도 걸린다. 3. X-ray film과 dried gel간의 orientation이 조금이라도 어긋나면 원하는 유전자를 cutting할 수 없다. 공통적인 단점 1. kit가격은 그리 비싸지는 않지만 후속되는 연구비가 생각보다 많다. cloning kit, sequencing의뢰, real-time PCR/RT-PCR 등등...