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KO strain을 확보하신 것만 해도 많은 연구 자원을 보유하신 것입니다. KO-strain의 genotype을 알려 주시면 더 자세히 말씀 드릴 수 있을 것 같지만 우선은 KO-strain을 확보해서 실험할 수 있는 것은 1) 특정배지에서 wild-type 과 KO strain의 비교 실험. --> 단순히 cell growth 비교 만으로도 많은 data를 얻을 수 있습니다. 배지내에 당을 바꾸어 줌으로써 sugar metabolism에 관여 하는지도 알 수있구요. 2) 말씀하신 대로 독성 chemical에 대한 반응성을 알 수 있습니다. --> microarray실험으로 gene 의 on/off를 분석할 수 있구요. 2-D를 걸어서 gene expression을 생각해 볼 수도 있겠네요. 3) 특정한 end-product를 생산하는 gene이라면 end-product분석으로도 재미있는 결과를 얻을 수 있을 것 같습니다. --> HPLC 실험이나 FPLC로 enzyme을 분리하는 실험이 있을 수 있겠네요. 4) 만약에 KO시킨 유전자를 cloning할 수 있다면 overexpression하였을 때 cell의 response는 어떤지를 관찰해 보아도 cell physiology에 대한 연구를 많이 할 수있을 것 같습니다. 5) 30 개의 유전자를 각각 하나씩 ON/OFF 시키면서 실험을 할 수 있는 여건이라면 metabolic engineering을 할 수 있는 최적의 조건이라 할 수 있을 것 같습니다. --> 물론 기본적으로 metabolite를 분석하는 실험은 있어야 합니다. 논문은 Metabolic engineering이라는 저널에 있는 많은 논문을 참고하시면 도움을 받으실 수 있습니다. 그럼, 좋은 실험결과 있으시길 바랍니다. >안녕하세요..질문이 약간 추상적인데요.. > >E.coli K12 strain에서 각 유전자 1개씩을 KO 시킨 strain이 30개정도 있는데요.. >이 유전자들은 일단 어떤 독성chemical에 대해 반응성이 있는 것으로 보여지는 >것들인데 KO strain으로 간단한 테스트를 통해 해당 유전자가 얼마나 그 독성물질에 >대해서 반응을 하는지 - 예를 들어 gene expression이나 등등 - 를 알 수 있는 >아이디어가 있을지 궁금합니다... > >간단하게는 Wild type과 growth test를 비교해서 해당 유전자가 그 독성물질에 >얼마나 중요한가(essential)를 비교측정하는게 있을것 같고요. 이런걸 fitness test라고 >하는거 같은데 맞는지 모르겠군요... >아니면 마이크로어레이실험을 해도 많은 정보를 얻을 수 있을것 같고요.... > >KO strain으로 해당 유전자의 특성을 분석하는 그외 방법론들이 있다면 간단하게 >제안해주셨으면 합니다..(특히 눈여겨 보신 적이 있는 논문들을 알려주시면 더 감사하겠습니다.) > >미리 감사드립니다.....

유전자 발현양상을 mRNA 발현과 protein level에서 2D 로 관찰을 연계시켜서 보는 방법도 좋을 것 같네요.... 유전자돌연변이가 전체 생체기작에 어떻게 영향을 주는지 전체적으로 볼 수 있거든요 독성물질에 접촉하지 않은것과 접촉한것 두 그룹으로 나누고 다시 각각에 대해서 돌연변이종과 야생종을 나누면 될것 같습니다. 그렇게 되면... 독성물질의 접촉여부에 따른 관련유전자군의 발현양상의 차이를 볼 수 있겠네요 >안녕하세요..질문이 약간 추상적인데요.. > >E.coli K12 strain에서 각 유전자 1개씩을 KO 시킨 strain이 30개정도 있는데요.. >이 유전자들은 일단 어떤 독성chemical에 대해 반응성이 있는 것으로 보여지는 >것들인데 KO strain으로 간단한 테스트를 통해 해당 유전자가 얼마나 그 독성물질에 >대해서 반응을 하는지 - 예를 들어 gene expression이나 등등 - 를 알 수 있는 >아이디어가 있을지 궁금합니다... > >간단하게는 Wild type과 growth test를 비교해서 해당 유전자가 그 독성물질에 >얼마나 중요한가(essential)를 비교측정하는게 있을것 같고요. 이런걸 fitness test라고 >하는거 같은데 맞는지 모르겠군요... >아니면 마이크로어레이실험을 해도 많은 정보를 얻을 수 있을것 같고요.... > >KO strain으로 해당 유전자의 특성을 분석하는 그외 방법론들이 있다면 간단하게 >제안해주셨으면 합니다..(특히 눈여겨 보신 적이 있는 논문들을 알려주시면 더 감사하겠습니다.) > >미리 감사드립니다.....