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codon optimize

Acidothermus celluloticus 라는 균주에서 작용하는 단백질을 식물이나 효모에서 발현을 시키고자 합니다. 이 균주는 genome map이 밝혀져서 원하는 단백질의 염기서열을 알고 있습니다. 그런데 이 단백질을 식물에 발현시키고자 할 때, codon optimize해서 식물의 codon에 적합하게 해야합니다. 1. 정확하게 codon optimze의 정의와 필요성을 알고 싶고요. 2. codon optimize하는 방법이나 방법을 알 수 있는 인터넷 사이트가 있으면 알려주십시오.
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답변 3
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    안길홍님의 답변

    2개의 site http://www.encorbio.com/protocols/Condon.htm http://nar.oxfordjournals.org/cgi/content/full/35/suppl_2/W126
    2개의 site http://www.encorbio.com/protocols/Condon.htm http://nar.oxfordjournals.org/cgi/content/full/35/suppl_2/W126
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    신재욱님의 답변

    답변이 될런지 모르겠으나 아래의 사이트를 참고해 보세요 중간부분에 DNA work에 codon optimization이 있습니다. http://syntheticbiology.org/Tools.html 여기는 free software도 있으니 참고하시기 바랍니다. https://www.dna20.com/
    답변이 될런지 모르겠으나 아래의 사이트를 참고해 보세요 중간부분에 DNA work에 codon optimization이 있습니다. http://syntheticbiology.org/Tools.html 여기는 free software도 있으니 참고하시기 바랍니다. https://www.dna20.com/
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    이상후님의 답변

    >Acidothermus celluloticus 라는 균주에서 작용하는 단백질을 >식물이나 효모에서 발현을 시키고자 합니다. 이 균주는 genome map이 밝혀져서 >원하는 단백질의 염기서열을 알고 있습니다. >그런데 이 단백질을 식물에 발현시키고자 할 때, >codon optimize해서 식물의 codon에 적합하게 해야합니다. > >1. 정확하게 codon optimze의 정의와 필요성을 알고 싶고요. > >2. codon optimize하는 방법이나 방법을 알 수 있는 인터넷 사이트가 있으면 > >알려주십시오. codon optimze는 sequence에서 codon분포를 최적화 하는 응용 프로그램입니다. codon optimze와 밀접히 관련된 사이트 소개합니다. http://www.genscript.com/codon_opt.html www.DNA20.com
    >Acidothermus celluloticus 라는 균주에서 작용하는 단백질을 >식물이나 효모에서 발현을 시키고자 합니다. 이 균주는 genome map이 밝혀져서 >원하는 단백질의 염기서열을 알고 있습니다. >그런데 이 단백질을 식물에 발현시키고자 할 때, >codon optimize해서 식물의 codon에 적합하게 해야합니다. > >1. 정확하게 codon optimze의 정의와 필요성을 알고 싶고요. > >2. codon optimize하는 방법이나 방법을 알 수 있는 인터넷 사이트가 있으면 > >알려주십시오. codon optimze는 sequence에서 codon분포를 최적화 하는 응용 프로그램입니다. codon optimze와 밀접히 관련된 사이트 소개합니다. http://www.genscript.com/codon_opt.html www.DNA20.com
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