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enzyme site를 포함한 primer design에 대해서

안녕하세요. 다음과 같이 primer를 design하였습니다. GC% Tm Fw : 5’GAATTCGAGGCACTCACCATGG 3’ 54.5%, 58.2℃ Rv:: 5’GAATTCGCTTGAGCTCTCTAGA 3’ 45.5%, 54.1℃ 앞쪽의 GAATTC는 EcoRI site로 pGEM T east vector와 다른 cloning vector에 cloning하기 위해 임의로 붙인겁니다. 주위에서 듣기론 EcoRI site앞에 임의로 6개정도 염기를 붙여야한다는 말도 있는데, 위와 같이 primer design해도 되는지요. 답변부탁드리겠습니다. 감사합니다^^
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    유용규님의 답변

    일전에 Legionella pneumophila vacJ 유전자 클로닝을 진행할 때 절단효소자리를 붙인 primer를 사용해서 실험을 했었는데요.... 저는 그냥 절단효소자리만 붙여서 했는데.. 잘됐었습니다 >안녕하세요. >다음과 같이 primer를 design하였습니다. > GC% Tm >Fw : 5’GAATTCGAGGCACTCACCATGG 3’ 54.5%, 58.2℃ >Rv:: 5’GAATTCGCTTGAGCTCTCTAGA 3’ 45.5%, 54.1℃ > >앞쪽의 GAATTC는 EcoRI site로 pGEM T east vector와 다른 cloning vector에 >cloning하기 위해 임의로 붙인겁니다. >주위에서 듣기론 EcoRI site앞에 임의로 6개정도 염기를 붙여야한다는 말도 있는데, >위와 같이 primer design해도 되는지요. >답변부탁드리겠습니다. 감사합니다^^ > >
    일전에 Legionella pneumophila vacJ 유전자 클로닝을 진행할 때 절단효소자리를 붙인 primer를 사용해서 실험을 했었는데요.... 저는 그냥 절단효소자리만 붙여서 했는데.. 잘됐었습니다 >안녕하세요. >다음과 같이 primer를 design하였습니다. > GC% Tm >Fw : 5’GAATTCGAGGCACTCACCATGG 3’ 54.5%, 58.2℃ >Rv:: 5’GAATTCGCTTGAGCTCTCTAGA 3’ 45.5%, 54.1℃ > >앞쪽의 GAATTC는 EcoRI site로 pGEM T east vector와 다른 cloning vector에 >cloning하기 위해 임의로 붙인겁니다. >주위에서 듣기론 EcoRI site앞에 임의로 6개정도 염기를 붙여야한다는 말도 있는데, >위와 같이 primer design해도 되는지요. >답변부탁드리겠습니다. 감사합니다^^ > >
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    전정용님의 답변

    T vector에 삽입하실거라면 상관없습니다. pcr의 결과 양쪽 끝에 모두 A 가 붙어 있기 때문에 cloning 자체가 잘되구요 이후에 e-site도 살아있기 때문에 실험할때 문제없을 겁니다. >안녕하세요. >다음과 같이 primer를 design하였습니다. > GC% Tm >Fw : 5’GAATTCGAGGCACTCACCATGG 3’ 54.5%, 58.2℃ >Rv:: 5’GAATTCGCTTGAGCTCTCTAGA 3’ 45.5%, 54.1℃ > >앞쪽의 GAATTC는 EcoRI site로 pGEM T east vector와 다른 cloning vector에 >cloning하기 위해 임의로 붙인겁니다. >주위에서 듣기론 EcoRI site앞에 임의로 6개정도 염기를 붙여야한다는 말도 있는데, >위와 같이 primer design해도 되는지요. >답변부탁드리겠습니다. 감사합니다^^ > >
    T vector에 삽입하실거라면 상관없습니다. pcr의 결과 양쪽 끝에 모두 A 가 붙어 있기 때문에 cloning 자체가 잘되구요 이후에 e-site도 살아있기 때문에 실험할때 문제없을 겁니다. >안녕하세요. >다음과 같이 primer를 design하였습니다. > GC% Tm >Fw : 5’GAATTCGAGGCACTCACCATGG 3’ 54.5%, 58.2℃ >Rv:: 5’GAATTCGCTTGAGCTCTCTAGA 3’ 45.5%, 54.1℃ > >앞쪽의 GAATTC는 EcoRI site로 pGEM T east vector와 다른 cloning vector에 >cloning하기 위해 임의로 붙인겁니다. >주위에서 듣기론 EcoRI site앞에 임의로 6개정도 염기를 붙여야한다는 말도 있는데, >위와 같이 primer design해도 되는지요. >답변부탁드리겠습니다. 감사합니다^^ > >
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    DELETED님의 답변

    >안녕하세요. >다음과 같이 primer를 design하였습니다. > GC% Tm >Fw : 5’GAATTCGAGGCACTCACCATGG 3’ 54.5%, 58.2℃ >Rv:: 5’GAATTCGCTTGAGCTCTCTAGA 3’ 45.5%, 54.1℃ > >앞쪽의 GAATTC는 EcoRI site로 pGEM T east vector와 다른 cloning vector에 >cloning하기 위해 임의로 붙인겁니다. >주위에서 듣기론 EcoRI site앞에 임의로 6개정도 염기를 붙여야한다는 말도 있는데, >위와 같이 primer design해도 되는지요. >답변부탁드리겠습니다. 감사합니다^^ > > Re:전혀 문제없습니다.
    >안녕하세요. >다음과 같이 primer를 design하였습니다. > GC% Tm >Fw : 5’GAATTCGAGGCACTCACCATGG 3’ 54.5%, 58.2℃ >Rv:: 5’GAATTCGCTTGAGCTCTCTAGA 3’ 45.5%, 54.1℃ > >앞쪽의 GAATTC는 EcoRI site로 pGEM T east vector와 다른 cloning vector에 >cloning하기 위해 임의로 붙인겁니다. >주위에서 듣기론 EcoRI site앞에 임의로 6개정도 염기를 붙여야한다는 말도 있는데, >위와 같이 primer design해도 되는지요. >답변부탁드리겠습니다. 감사합니다^^ > > Re:전혀 문제없습니다.
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