2009-08-25
org.kosen.entty.User@4fa39037
고재영(nazca71)
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천연물 구조분석중인데요..순수하게 분리를 하였고..
질량값을 얻었습니다. low resolution으로요..
질량값만 가지고 비슷한 범위의 천연물을 동정할 수 있는 방법이 있는지요?
육상천연물에 대한 데이타베이스 같은거요..
예를들어 질량값 범위를 입력하면 가능한 천연물 리스트가 나오는..방법좀 부탁드립니다.
- 천연물
- 구조분석
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답변 2
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답변
조윤환님의 답변
2009-08-25- 0
첨부파일
우선 무료 DB론 다음이 있습니다. 1. NIST Chemistry WebBook 2. SDBS Integrated Spectral Data Base System for Organic Compounds 조금만 검색해 보시면 찾으실 수 있을 겁니다. 하지만 생각처럼 쉽지 않을 겁니다. 대부분 합성 물질들에 대한 것이기 때문이죠. 유료 DB도 여러 가지 있지만. .....Wiley 출판사에서 만든 ffnsc라는 DB가 화합물 분류별로 잘 되어 있는 편입니다. 수록 목록을 첨부 합니다. 참고하세요. 분자량 순으로 되어 있으니 데이터와 한번 비교해 보시면 찾을 수 있을지도 모르죠. 하지만 천연물 중에서 MS 데이터가 확보되어 있는 물질이 몇 %나 될까요? 또 DB에 수록된 물질은 얼마나 될까요? 행운이 따르길 기원합니다. -
답변
DELETED님의 답변
2009-08-26- 0
Chapman hill 사의 천연물 사전이 있고 그뒤에 인덱스 기능이 있어 분자량으로 찾을 수 있을 듯 합니다. 제생각으로 NMR을 찍으면 더 좋을 듯합니다. 그리고 만일 분리하신 천연물의 학명을 알고 어느정도 감을 잡으실 수 있습니다. 천연물 사전이 있는데 그것을 활용하면 거의 유사한 것을 찾을 가능성이 높습니다. 우선 학명상의 그 식물이나 미생물에서 나오는 화합물의 구조를 다 조사합니다. 그래서 유사한 것이 없으면 속명으로만 다시 조사합니다. 만일 물리적인 특성 즉 물질이 비극성 인지 극성이 강한지 UV 흡수는 어떤지 등을 염두에 두고 사전에나온 구조에서 후보를 고른 다음 분자량에 더하여 NMR 특히 13C-NMR까지 구 할 수 있으면 거의 80-90% 골격을 확인 할 수 있을 가능성이 높습니다. 더 세세한 구조 는 2D NMR을 찍어야 결정될 가능성이 높습니다. 이렇게 해도 정말 없다면 진짜로 새로운 물질을 얻었을 가능성이 높으니 비록 구조 결정이 어렵더라도 희망을 가져볼만 하겠죠......... >천연물 구조분석중인데요..순수하게 분리를 하였고.. >질량값을 얻었습니다. low resolution으로요.. >질량값만 가지고 비슷한 범위의 천연물을 동정할 수 있는 방법이 있는지요? >육상천연물에 대한 데이타베이스 같은거요.. > >예를들어 질량값 범위를 입력하면 가능한 천연물 리스트가 나오는..방법좀 부탁드립니다.