2010-07-14
org.kosen.entty.User@3676952d
이수연(haemong82)
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안녕하세요?
MALDI-TOF 관련 논문을 공부하고 있는데요,
데이터에 Number of missed cleavage site
라는 항목이 있는데 이게 무엇을 의미하는지 알려주세요..
제가 이쪽은 경험이 전혀 없어서요 ㅠㅠ
꼭 답변 부탁드리겠습니다.
- Missed cleavage
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각 분야 한인연구자와 현업 전문가분들의 답변을 기다립니다.
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답변 1
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답변
장성재님의 답변
2010-07-14- 0
질량분석기 등으로 프로테옴을 분석할 때에는 단백질 분해효소를 처리하는 데, 효소가 잘라내지 못한 지점들을 missed cleavage 라고 부릅니다. 단백질 검색 프로그램에서는 missed cleavage 의 최대 개수를 변수로 입력하며, missed cleavage 수의 증가는 계산시간을 기하급수적으로 증가시킵니다. 또한, 펩타이드의 범위가 확대됨으로써 계산의 정확성을 떨어뜨리고 false positive 가 증가시킵니다. 그러므로, 효율적인 검색을 위해서는 가능한한 missed cleavage를 줄일 수 있도록 실험을 최적화하고, 검색 프로그램에서는 그 값을 1 또는 2 이하로 제한하는 것이 바람직하다고 합니다.