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지식나눔

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RNA, DNA loading buffer

2010-10-01 org.kosen.entty.User@3a937cfb 장현희(petfrog)
  • 1
tissue에서 RNA extraction 후, 전기영동하여 RNA 밴드를 확인했는데. dye를 DNA loading buffer을 사용하였습니다. RNA band를 보는 것인데 상관이 없나요??? band가 smear하게 나와서 loading buffer 때문인지 아니면 RNA가 degradation된 건지 잘 모르겠네요
  • loading buffer
  • DNA
  • RNA
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답변 1
  • 답변

    김윤상님의 답변

    2010-10-01
    • 0
    그냥 RNA의 integrity를 확인하는 목적이라면, 일반 Agarose gel electrophoresis를 TAE 혹은 TBE buffer에서 사용하셔도 됩니다. Loading dye도 같은 것을 써도 상관 없습니다. 간혹 buffer 나 dye를 여러 사람이, 혹은 한 사람이 여러 용도로 사용하다보면, RNase 가 오염되기도 하지만, 조금만 주의를 기울이면 큰 문제는 없습니다. RNA를 denature 시키기 위해서 일반 loading dye에 추가로 formamide를 넣는 건 보너스입니다.
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    그냥 RNA의 integrity를 확인하는 목적이라면, 일반 Agarose gel electrophoresis를 TAE 혹은 TBE buffer에서 사용하셔도 됩니다. Loading dye도 같은 것을 써도 상관 없습니다. 간혹 buffer 나 dye를 여러 사람이, 혹은 한 사람이 여러 용도로 사용하다보면, RNase 가 오염되기도 하지만, 조금만 주의를 기울이면 큰 문제는 없습니다. RNA를 denature 시키기 위해서 일반 loading dye에 추가로 formamide를 넣는 건 보너스입니다.
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