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ABI 홈페이지에 제공된 자료를 보고 QPCR를 분석했습니다. 자료의 나온 Comparative ct값 계산은 이해가 되는데.. 그곳 자료에는 그래프로 데이타를 표시한 것이 아닌 평균값이 5.6 라고 하면 SD값은 (5.3 -6.0) 식으로 표시를 해 두었네요.. 이 값을 그래프로 표시하려고 한다면 어떤 값이 SD 값이 되어야 하나요?
5.3, 5.6, 6.0 을 이용하여 평균값과 SD 값을 다시 구해야 하나요?
아니면 S=(S12 + S22) 1/2 로 계산된 값이 그냥 SD값이 되는 건가요?
그런데 이값을 SD값으로 보기에는 2-ddCt 로 계산된 것이 아니니까 맞지 않는 것 같아서요. 또 이값을 2-SD 로 계산을 한다해도 좀 결과가 맞지 않는 것 같아서요.
고수님들 QPCR 데이타를 그래프로 만들려면 어떻게 해야 하나요?
가르쳐 주세요~~--;
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각 분야 한인연구자와 현업 전문가분들의 답변을 기다립니다.
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답변
김윤상님의 답변
2011-08-17- 2
첨부파일
http://www3.appliedbiosystems.com/cms/groups/mcb_support/documents/generaldocuments/cms_040980.pdf
위 웹사이트에 나온 데이터를 가지고 분석을 해 보신 모양이군요.
말씀하신 SD 값 (5.3-6.0)은 SD 값이 아니라 range(값의 범위)입니다.
왼쪽 column에 보면, -2.50 +/- 0.10 이라고 나오는데,
이 중 +/- 0.10 이라고 써진 부분이 SD가 됩니다.
이 값을 대입해서 계산하면, 2^(2.5-0.1) 은 대략 5.3 이 나오고,
2^(2.5+0.1)은 대략 6.0 이 나옵니다.
범위는 이렇게 해서 구해진 것입니다.
만약 그래프에서 표시를 하려면, 평균값은 2^(2.5) 이 되고,
SD는 아래쪽은 2^(2.5)-2^(2.4),
위쪽은 2^(2.6)-2^(2.5)로 놓으시면 됩니다.
엑셀을 사용하신다면, 위 아래 오차값을 다르게 대입하는 기능이 있으니까
그것을 이용하시면 됩니다.
도움이 되었기를 빕니다. -
답변
김상태님의 답변
2011-08-31- 0
-평균:5.633 SD=0.35입니다 이를 이용 CT값을 게산합니다-------------------------------------질문-------------------------------------
ABI 홈페이지에 제공된 자료를 보고 QPCR를 분석했습니다. 자료의 나온 Comparative ct값 계산은 이해가 되는데.. 그곳 자료에는 그래프로 데이타를 표시한 것이 아닌 평균값이 5.6 라고 하면 SD값은 (5.3 -6.0) 식으로 표시를 해 두었네요.. 이 값을 그래프로 표시하려고 한다면 어떤 값이 SD 값이 되어야 하나요?
5.3, 5.6, 6.0 을 이용하여 평균값과 SD 값을 다시 구해야 하나요?
아니면 S=(S12 + S22) 1/2 로 계산된 값이 그냥 SD값이 되는 건가요?
그런데 이값을 SD값으로 보기에는 2-ddCt 로 계산된 것이 아니니까 맞지 않는 것 같아서요. 또 이값을 2-SD 로 계산을 한다해도 좀 결과가 맞지 않는 것 같아서요.
고수님들 QPCR 데이타를 그래프로 만들려면 어떻게 해야 하나요?
가르쳐 주세요~~--;
페이지 15에 나오는 표에서 나온 값인거죠?