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생화학 기초 공부가 부족한 연구원입니다.
위 그림을 아무리 이해를 할려고 해도 힘드네요
aconitae라는 효소의 작용기전에 대해 설명해 놓은 건데.
알기 쉽게 설명 좀 부탁드립니다.
- 효소
- 작용기전
- 메카니즘
각 분야 한인연구자와 현업 전문가분들의 답변을 기다립니다.
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답변
이상후님의 답변
2011-09-20- 0
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우선 aconitase의 active site에 citrate가 결합을 하게 되면 active site에 있는 아미노산 잔기 중에 His의 -H를 citrate의 C2에 결합한 -OH의 oxygen이 공격을 하게 되어 결국 물분자가 떨어져 나가게 되며 이와 동시에 강력한 electronegativity를 띄는 aconitase의 active site에 있는 serine의 -OH group이 citrate의 C3에 결합된 -H을 공격해서 deprotonation을 유발시켜서 citrate에 이중결합을 만들게 됩니다. 이렇게 해서 형성된 구조가 cis-aconitate라고 합니다. 180' rotate라는 말은 cis-aconitate의 구조를 보기 편하고 효소 작용 기작을 보기좋게 설명하게 180' 회전시켰다는 말이지 실제 반응에서는 변하는 것은 없습니다. 다시 His이 물분자를 activation 시켜서 물분자의 -OH group이 C3 carbon을 공격함과 동시에 cis-aconitase에 있는 이중결합 부위(전자가 상대적으로 풍부해서 반응성이 좋은 상태) 가 active site에 있는 serine의 -OH group중에 H를 공격하여 결국, C3에 -OH group이 결합되고 이중경합은 단일결합으로 다시 환원이 되게 됩니다. 결국 최종적으로 만들어지는 반응이 isocitrate입니다. isocitrate를 이리저리 돌리게 되면 마지막에서 2번째 구조와 평형상태를 이루게 됩니다. 물론 같은 구조입니다. 이해가 되시길 바랍니다...
생화학 기초 공부가 부족한 연구원입니다.
위 그림을 아무리 이해를 할려고 해도 힘드네요
aconitae라는 효소의 작용기전에 대해 설명해 놓은 건데.
알기 쉽게 설명 좀 부탁드립니다.
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답변
황인성님의 답변
2011-09-20- 0
윗분이 잘 설명해주셨는데 한 가지만 첨언하겠습니다.
cis-aconitate가 180도 rotate되는 것은 실제로 효소 내에서 일어나는 일입니다. 맨 마직막 단계만 보기 좋게 돌려놓은 것입니다.
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생화학 기초 공부가 부족한 연구원입니다.
위 그림을 아무리 이해를 할려고 해도 힘드네요
aconitae라는 효소의 작용기전에 대해 설명해 놓은 건데.
알기 쉽게 설명 좀 부탁드립니다.