2012-04-13
org.kosen.entty.User@265cc790
이승규(sklee0125)
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안녕하세요.
실험하시는 분이면 간단한 질문 일 수 있는 거 같은데, 급해서 여쭈어 봅니다.
rat 신경세포와 mouse neuroblastoma로 만든 세포에서 rnai를 하고자 할 때 rat을 기준으로 하나요? 아니면 mouse를 기준으로 해야 하나요?
- sirna
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답변 2
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답변
이상열님의 답변
2012-04-20- 2
윗분께서 설명하신 것처럼 rat과 mouse에서 target gene이 무엇이고 그 target gene의 homology를 먼저 찾으세요 (rat과 mouse target gene alignment). 그게 일차적인 해결책입니다. alignment후 homology를 알고 sequence 결과를 알면 쉽게 해결됩니다. siRNA혹은 shRNA 어느 방법을 사용하실지 모르지만 어느 방법이나 쉽게 해결되리라 생각됩니다. 만약 서로 다른 개체의 세포라면 문제가 될 가능성이 있어 보입니다만 같은 설치류라면 문제가 될 것이 없어보입니다. -
답변
장성재님의 답변
2012-04-19- 0
Target gene이 어떤 것인지 모르지만, rat과 mouse라면 상당 부분 유전자 서열에 homology가 높으므로, siRNA 후보군에서 homology가 큰 것을 선택하시면 좋을 듯 싶습니다. 동일한 유전자 서열 부위가 없다면 아마도 따로 테스트 해보셔야 할 듯.... fusion에 의해 어떻게 유전자의 재배열이 일어났는지를 정확히 파악하고 계신다면 문제될 것을 없겠죠.