지식나눔

microinjection of dsRNA into oocyte

siRNA를 GV oocyte에 microinjection을 하는데요 siRNA를 elution하는 buffer로 1%DEPC를 사용하였는데요~ 보통 TE buffer나 siRNA buffer를 사용한다고 해서요~ oocyte에 0.1%DEPC가 toxic한지 궁금합니다~
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답변 3
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    황규찬님의 답변

    난자 미세주입으로 외래 유전자 혹은 siRNA를 넣을 때 TE buffer, TE buffer에서 E(EDTA)만 제거된 buffer 혹은 전용 siRNA buffer를 사용하는것이 좋을 듯합니다. 왜냐하면,  DEPC는 일반적으로 실험실에서 RNase enzyme 억제제로 사용되지만, 몇몇 아미노산 (히스티딘, 라이신, 시스테인, 타이로신) 등에 covalent modification을 유발하여 번역(translation) 등 다른 단백질의 기능을 저하 시킬 수 있습니다.
    난자 미세주입으로 외래 유전자 혹은 siRNA를 넣을 때 TE buffer, TE buffer에서 E(EDTA)만 제거된 buffer 혹은 전용 siRNA buffer를 사용하는것이 좋을 듯합니다. 왜냐하면,  DEPC는 일반적으로 실험실에서 RNase enzyme 억제제로 사용되지만, 몇몇 아미노산 (히스티딘, 라이신, 시스테인, 타이로신) 등에 covalent modification을 유발하여 번역(translation) 등 다른 단백질의 기능을 저하 시킬 수 있습니다.
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    이상열님의 답변

    DEPC가 저농도라도 사용하지 않는 것이 좋릏 것입니다. 난자에 다방면에 상당한 영향을 미칠 것이니 가급적 사용하지 마시고 TE를 사용하는데 이도 일반적인 농도보다 10배가량 낮은 농도를 사용하는 것이 좋습니다. 
    DEPC가 저농도라도 사용하지 않는 것이 좋릏 것입니다. 난자에 다방면에 상당한 영향을 미칠 것이니 가급적 사용하지 마시고 TE를 사용하는데 이도 일반적인 농도보다 10배가량 낮은 농도를 사용하는 것이 좋습니다. 
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    장성재님의 답변

    원하시는 실험이 DEPC에 의한 영향을 보는 것이 아니고, 대조군에 DEPC only, 또는 DEPC가 포함된 control siRNA를 사용하신다면 siRNA에 의한 영향을 평가하는데 문제가 없을 수 있습니다.

    하기 논문을 참조하세요.

    Scientific Reports 4, Article number: 5417 (2014)
     
    원하시는 실험이 DEPC에 의한 영향을 보는 것이 아니고, 대조군에 DEPC only, 또는 DEPC가 포함된 control siRNA를 사용하신다면 siRNA에 의한 영향을 평가하는데 문제가 없을 수 있습니다.

    하기 논문을 참조하세요.

    Scientific Reports 4, Article number: 5417 (2014)
     
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