지식나눔

WNT ligand & NFKB interaction

WNT 신호전달은 생물학에서 많은 역할을 한다고 알려져 있는데요
WNT ligand protein (Wnt1, Wnt2, Wnt2B, Wnt3, Wnt3A, Wnt4, Wnt5A..,etc)이 receptor를 인식하면 WNT OFF ==> Wnt ON 상태로 바뀌면서 하위  신호전달이 진행된다고 알려져 있습니다.
여기서 제가 궁금한것은 NFKB가 WNT를 조절하는 upstream일수 있다는 가정하에 WNT on 을 유도하는 ligands를 조절한다는겁니다. 그래서....ligands wnt protein과 NFKB의 interaction을 immunoprecipitation으로 확인을 하는게 가능한지... 의문점이 들어서요. 적절한 ref.,를 확인하지 못하였습니다.
ps: nfkb 억제, 활성화에 따른  wnt 신호전달 변화들은 확인을 하였습니다.
  • WNT ligand
  • NFKB
  • IP
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답변 3
  • 답변

    김형택님의 답변

    간단하게 Wnt를 activation을 시킨 다음에 NF-kB의 phospholation을 보시면 되는거 아닌가요?
    WB로 바로 확인 가능할꺼 같습니다.
    간단하게 Wnt를 activation을 시킨 다음에 NF-kB의 phospholation을 보시면 되는거 아닌가요?
    WB로 바로 확인 가능할꺼 같습니다.
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  • 답변

    한민준님의 답변

    질문하신 내용이 정확하지가 않아서 제가 확실하게 질문 내용을 이해했는지 모르겠네요...ㅠㅠ..
    NFKB가 WNT를 조절하는 upstream일수 있다는 가정 --> NFkB는 transcription factor인데요 가정하고 계신것이 "NFkB가 WNT transcription을 regulation한다"인가요? 그렇다면 IP가 아닌 ChIP을 사용해서 NFkB가 WNT promoter에 binding해서 wnt transcription을 "ON"하는지를 보여주어야 합니다. 
    다만 가정하고 계신 가설은 좀 문제가 있습니다. 
    WNT ligand (Wnt)는 cell에서 만들어져서 secretion이 되어서 다른 cell에 있는 receptor에 붙어서 signaling을 "ON" 합니다. 따라서 cell 안에 있는 NFkB와 cell 밖에 있는 Wnt ligand가 직접적인 interaction을 해서 function을 regulation하기는 어렵습니다. 
    질문하신 내용이 정확하지가 않아서 제가 확실하게 질문 내용을 이해했는지 모르겠네요...ㅠㅠ..
    NFKB가 WNT를 조절하는 upstream일수 있다는 가정 --> NFkB는 transcription factor인데요 가정하고 계신것이 "NFkB가 WNT transcription을 regulation한다"인가요? 그렇다면 IP가 아닌 ChIP을 사용해서 NFkB가 WNT promoter에 binding해서 wnt transcription을 "ON"하는지를 보여주어야 합니다. 
    다만 가정하고 계신 가설은 좀 문제가 있습니다. 
    WNT ligand (Wnt)는 cell에서 만들어져서 secretion이 되어서 다른 cell에 있는 receptor에 붙어서 signaling을 "ON" 합니다. 따라서 cell 안에 있는 NFkB와 cell 밖에 있는 Wnt ligand가 직접적인 interaction을 해서 function을 regulation하기는 어렵습니다. 
    성경주(skj) 2019-03-05

    감사합니다

  • 답변

    임창임님의 답변

    염증에서 Wnt와 NF-kB 신호전달 과정이 서로 상호작용한다는 리뷰 논문 첨부합니다.

    이미 각각의 신호전달이 알려진 과정이라면, 세부 과정에 참여하는 molecules 의 발자국을 따라가 보시면 될 것 같습니다. 마지막에 관심가는 molecules이 서로 만나는지 혹은 과정 중간 중간에 만나는지는 역시나 실험적으로 규명해 볼 필요가 있을 것으로 생각합니다. 둘이 직접 만난다면 면역침전이 대표적으로 사용되나, 세포/조직 내 두 molecules의 immunostaining/IF 등으로도 double staining으로 간접적으로 확인할 수 있을 것입니다.

    참고하시면 좋겠습니다.

     
    염증에서 Wnt와 NF-kB 신호전달 과정이 서로 상호작용한다는 리뷰 논문 첨부합니다.

    이미 각각의 신호전달이 알려진 과정이라면, 세부 과정에 참여하는 molecules 의 발자국을 따라가 보시면 될 것 같습니다. 마지막에 관심가는 molecules이 서로 만나는지 혹은 과정 중간 중간에 만나는지는 역시나 실험적으로 규명해 볼 필요가 있을 것으로 생각합니다. 둘이 직접 만난다면 면역침전이 대표적으로 사용되나, 세포/조직 내 두 molecules의 immunostaining/IF 등으로도 double staining으로 간접적으로 확인할 수 있을 것입니다.

    참고하시면 좋겠습니다.

     
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