2020-10-07
org.kosen.entty.User@63bbf5af
조수호(kist22)
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논문 실험 data에서 IP와 Input를 비교하는 것이 나옵니다.
여기서 IP와 Input은 어떤 의미인지 궁금합니다.
그리고 물질(성분) 앞에 sh있으면 nockout 되었다하던데 그 의미가 궁금합니다.
여기서 IP와 Input은 어떤 의미인지 궁금합니다.
그리고 물질(성분) 앞에 sh있으면 nockout 되었다하던데 그 의미가 궁금합니다.
- hepatocyte
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답변 3
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답변
한민준님의 답변
2020-10-08- 3
IP (immunoprecipitation)은 특정 단백질에 binding 하는 단백질을 확인하는 기법입니다. 단백질 A를 antibody A로 pull-down해서 여기에 단백질 B가 binding 한다면 IP 후에 antibody B로 확인이 가능하겠죠. input은 일종의 control로 IP 과정중에 특정 단백질들이 샘플안에 존재한다는 의미입니다. 마찬가지로 IgG를 이용한 control도 필요합니다. 이 경우는 IgG antibody로 IP를 경우에는 우리가 원하는 단백질 B가 검출이 되지 않아야 하겠죠..
shRNA를 의미하는 거 같은데요 shRNA (short hairpin RNA)는 특정 유전자를 silence 시킬수 있기때문에 Knock-down 실험에 주로 사용합니다. 엄밀하게 말하면 Knock-out은 아니구요. Knock-out을 시키려면 CRISPR-Cas9이나 TALEN과 같은 유전자 편집 기술을 이용해야 합니다. -
답변
장성재님의 답변
2020-10-08- 1
위에 답변을 주신 분께서 대략적으로 설명을 잘해주셨습니다만, 님께서 보신 논문을 알려주셔야 정확한 의미를 설명드릴 수 있을 것 같습니다.. -
답변
김헌성님의 답변
2020-10-21- 1
IP (immunoprecipitation)은 특정 단백질에 binding 하는 단백질을 확인하는 실험입니다.
bead를 사용하여 실험을 합니다.
input은 I.P의 control 군을 말합니다.
sh는 shRNA를 말하는 것이고요 비슷한게 Si-RNA (small(또는 short) interfering RNA) 특정유전자를 Knock down 시키고요 shRNA는 (short hairpin RNA) 특정유전자를 Knock out 시키는 역할을 합니다.