지식나눔

SDS PAGE를 transfer할때 mA가 계속 증가되는 이유가 무엇일까요??ㅠ.ㅠ

안녕하세요. 제가 계속 Transfer를 할때면 0.4A 부근에서 시작합니다. 젤은 길이가 좀 긴젤이구요 10%이며, 2판을 트랜스퍼합니다. 트랜스퍼 버퍼는 트리스와 glycine만 들어가고 1L 당 메탄올 200ml을 넣고 버퍼를 만듭니다. 트리스와 글리신을 다녹이고 total vol. 750ml인 상태에서pH8.5로 맞춘뒤, 800ml로 맞춥니다. 그뒤 메탄올을 200ml 넣고, stir 10초 정도한뒤, 500ml나누어서 2통에 담고 4도에 보관합니다. 트랜스퍼할 때는 가능한 버퍼를 상온에 잠시 두고 시작합니다,. membrane은 PVDF입니다. (메탄올로 activation시킨뒤, 트랜스퍼 버퍼에 담은채, 트랜스퍼 할때까지 상온에 둡니다.(당일날 트랜스퍼하고, SDS gel running할때 준비합니다.) 그뒤 트랜스퍼를 하게되면, 처음 쓰는 트랜스퍼버퍼인데도 불구하고 100V에서 0.38A로 시작하더니 10분도 안되어서 0.40으로 증가합니다. 도저히 안되어서 90V에서 낮추고 하니 한 30분지나서 또 0.40A로 되어버려서 85V에서 2시간 정도 합니다. 다른 분들이 만들고 쓰던 버퍼를 사용해도, 다른 분들이 만든 새 버퍼를 사용해도 제가 할때만 A가 유독증가하고, 다른 분들은 100V에서 0.29A나 0.35A정도나옵니다. 제가 할때만 100V에서 0.39A로 됩니다.다른분들은 보통 길이의 10%젤을 사용합니다. 원래 100V에서 1시간 반을 해야하나 저는 잘안되어서 80V에서 2시간정도 합니다. 그래도 버퍼나 젤이 뜨겁다는 것을 느낍니다. 잘 트랜스퍼가 되지도 않구요.. 제가 어디를 이상하게 하기에 이렇게 트랜스퍼가 안될까요?? ㅠ.ㅠ 몇개월동안 샘플만 날리네요...ㅠㅠ. 도와주세요..
  • 트랜스퍼
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답변 2
  • 답변

    장병기님의 답변

    제가 사용하는 1X transfer buffer 입니다. 1L : 5.8 g Tris base + 2.9 g Glycine + 3.7 ml 10% SDS + 200 ml Methanol/1L mini transfer kit(Bio-Rad) 에서 transfer 시에 150 mA 로 놓으면 50-60V 정도 걸립니다. transfer 는 오래해도 상관없습니다. 저는 2시간 이상... 바쁘면 4-5 시간도 둡니다. overnight 상관없습니다. mini transfer kit 에 아이스 박스 넣으면 온도가 뜨거울 정도로 올라가지는 않습니다. membrane 을 methanol 에 적신 후 따로 버퍼에 옮겨 보관할 필요는 없습니다. 바로 transfer 에 사용하세요. 버퍼에 pH 를 맞출 필요는 없습니다. 버퍼 보관은 상온입니다. 4'C 에 보관하면 SDS 가 침전 될수 있습니다. gel 의 % 나 두께가 전압에 미치는 영향은 미미 합니다. 단 transfer 된 단백질 양에 차이가 있을수는 있습니다. 그냥 맘편히 오래 transfer 해도 무관합니다. big transfer kit 에 사용시 150-200mA 걸어주면 대략 20-30V 걸리며 이 경우 overnight 해 줍니다. midi transfer kit 에 사용시도 비슷하게 해주면 됩니다. 그럼 잘 되시길... >안녕하세요. >제가 계속 Transfer를 할때면 0.4A 부근에서 시작합니다. >젤은 길이가 좀 긴젤이구요 10%이며, 2판을 트랜스퍼합니다. >트랜스퍼 버퍼는 트리스와 glycine만 들어가고 1L 당 메탄올 200ml을 넣고 >버퍼를 만듭니다. 트리스와 글리신을 다녹이고 total vol. 750ml인 상태에서pH8.5로 맞춘뒤, 800ml로 맞춥니다. 그뒤 메탄올을 200ml 넣고, stir 10초 정도한뒤, 500ml나누어서 2통에 담고 4도에 보관합니다. > >트랜스퍼할 때는 가능한 버퍼를 상온에 잠시 두고 시작합니다,. >membrane은 PVDF입니다. (메탄올로 activation시킨뒤, 트랜스퍼 버퍼에 담은채, 트랜스퍼 할때까지 상온에 둡니다.(당일날 트랜스퍼하고, SDS gel running할때 준비합니다.) 그뒤 트랜스퍼를 하게되면, 처음 쓰는 트랜스퍼버퍼인데도 불구하고 100V에서 0.38A로 시작하더니 10분도 안되어서 0.40으로 증가합니다. >도저히 안되어서 90V에서 낮추고 하니 한 30분지나서 또 0.40A로 되어버려서 85V에서 2시간 정도 합니다. > >다른 분들이 만들고 쓰던 버퍼를 사용해도, 다른 분들이 만든 새 버퍼를 사용해도 제가 할때만 A가 유독증가하고, 다른 분들은 100V에서 0.29A나 0.35A정도나옵니다. 제가 할때만 100V에서 0.39A로 됩니다.다른분들은 보통 길이의 10%젤을 사용합니다. 원래 100V에서 1시간 반을 해야하나 저는 잘안되어서 80V에서 2시간정도 합니다. 그래도 버퍼나 젤이 뜨겁다는 것을 느낍니다. 잘 트랜스퍼가 되지도 않구요.. >제가 어디를 이상하게 하기에 이렇게 트랜스퍼가 안될까요?? ㅠ.ㅠ >몇개월동안 샘플만 날리네요...ㅠㅠ. 도와주세요..
    제가 사용하는 1X transfer buffer 입니다. 1L : 5.8 g Tris base + 2.9 g Glycine + 3.7 ml 10% SDS + 200 ml Methanol/1L mini transfer kit(Bio-Rad) 에서 transfer 시에 150 mA 로 놓으면 50-60V 정도 걸립니다. transfer 는 오래해도 상관없습니다. 저는 2시간 이상... 바쁘면 4-5 시간도 둡니다. overnight 상관없습니다. mini transfer kit 에 아이스 박스 넣으면 온도가 뜨거울 정도로 올라가지는 않습니다. membrane 을 methanol 에 적신 후 따로 버퍼에 옮겨 보관할 필요는 없습니다. 바로 transfer 에 사용하세요. 버퍼에 pH 를 맞출 필요는 없습니다. 버퍼 보관은 상온입니다. 4'C 에 보관하면 SDS 가 침전 될수 있습니다. gel 의 % 나 두께가 전압에 미치는 영향은 미미 합니다. 단 transfer 된 단백질 양에 차이가 있을수는 있습니다. 그냥 맘편히 오래 transfer 해도 무관합니다. big transfer kit 에 사용시 150-200mA 걸어주면 대략 20-30V 걸리며 이 경우 overnight 해 줍니다. midi transfer kit 에 사용시도 비슷하게 해주면 됩니다. 그럼 잘 되시길... >안녕하세요. >제가 계속 Transfer를 할때면 0.4A 부근에서 시작합니다. >젤은 길이가 좀 긴젤이구요 10%이며, 2판을 트랜스퍼합니다. >트랜스퍼 버퍼는 트리스와 glycine만 들어가고 1L 당 메탄올 200ml을 넣고 >버퍼를 만듭니다. 트리스와 글리신을 다녹이고 total vol. 750ml인 상태에서pH8.5로 맞춘뒤, 800ml로 맞춥니다. 그뒤 메탄올을 200ml 넣고, stir 10초 정도한뒤, 500ml나누어서 2통에 담고 4도에 보관합니다. > >트랜스퍼할 때는 가능한 버퍼를 상온에 잠시 두고 시작합니다,. >membrane은 PVDF입니다. (메탄올로 activation시킨뒤, 트랜스퍼 버퍼에 담은채, 트랜스퍼 할때까지 상온에 둡니다.(당일날 트랜스퍼하고, SDS gel running할때 준비합니다.) 그뒤 트랜스퍼를 하게되면, 처음 쓰는 트랜스퍼버퍼인데도 불구하고 100V에서 0.38A로 시작하더니 10분도 안되어서 0.40으로 증가합니다. >도저히 안되어서 90V에서 낮추고 하니 한 30분지나서 또 0.40A로 되어버려서 85V에서 2시간 정도 합니다. > >다른 분들이 만들고 쓰던 버퍼를 사용해도, 다른 분들이 만든 새 버퍼를 사용해도 제가 할때만 A가 유독증가하고, 다른 분들은 100V에서 0.29A나 0.35A정도나옵니다. 제가 할때만 100V에서 0.39A로 됩니다.다른분들은 보통 길이의 10%젤을 사용합니다. 원래 100V에서 1시간 반을 해야하나 저는 잘안되어서 80V에서 2시간정도 합니다. 그래도 버퍼나 젤이 뜨겁다는 것을 느낍니다. 잘 트랜스퍼가 되지도 않구요.. >제가 어디를 이상하게 하기에 이렇게 트랜스퍼가 안될까요?? ㅠ.ㅠ >몇개월동안 샘플만 날리네요...ㅠㅠ. 도와주세요..
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    윤영민님의 답변

    앞서 구체적으로 좋은 답변주셨는데, 질문자님이 궁금하신 내용에 조금이나마 도움될까봐 그 원리를 말씀드립니다. 우선 핵심은 트랜스퍼 버퍼를 상온에 보관하셔야 하는 거구요, 4도에 보관하셨다면 상온에서 천천히 stirring을 해줘야 하는데, 버퍼의 물질마다 다르겠지만 제 생각엔 12시간 이상 해줄 필요가 있다고 봅니다. 그리고 그 원리를 살펴보면, 같은 용매 조성에 같은 질량의 용질이 녹아있어도 그 용액의 상태에 따라 전기전도성이 다를 수 있다는 겁니다. 예를 들어 순수한 물의 전기전도도는 낮지만, 극미량의 불순물이 들어가면 전기전도도는 급격히 올라갑니다. 불순물이 없더라도 여러 물질이 녹아있는 용액에서는 그 용질의 입자 사이즈에 따라 전기전도성이 달라집니다. 분자레벨로 고르게 분산되어 있다면 전기에너지가 트랜스퍼 흐름에 집중되어 트랜스퍼 효율도 높아지지만(분리 시간이 짧아지겠지요), 여러 분자가 뭉친 상태로 존재한다면 전기에너지가 입자끼리의 충돌이나 전환 등으로 열 등의 다른 에너지로 전환되며, 그 만큼의 에너지가 트랜스퍼 효율이 떨어지는 결과로 이어지겠지요. 참고로 분산된 용액에서의 입자 사이즈가 작을수록 good dispersion이고 클수록 poor dispersion입니다. 논문이나 자료 검색에 참조하세요. >안녕하세요. >제가 계속 Transfer를 할때면 0.4A 부근에서 시작합니다. >젤은 길이가 좀 긴젤이구요 10%이며, 2판을 트랜스퍼합니다. >트랜스퍼 버퍼는 트리스와 glycine만 들어가고 1L 당 메탄올 200ml을 넣고 >버퍼를 만듭니다. 트리스와 글리신을 다녹이고 total vol. 750ml인 상태에서pH8.5로 맞춘뒤, 800ml로 맞춥니다. 그뒤 메탄올을 200ml 넣고, stir 10초 정도한뒤, 500ml나누어서 2통에 담고 4도에 보관합니다. > >트랜스퍼할 때는 가능한 버퍼를 상온에 잠시 두고 시작합니다,. >membrane은 PVDF입니다. (메탄올로 activation시킨뒤, 트랜스퍼 버퍼에 담은채, 트랜스퍼 할때까지 상온에 둡니다.(당일날 트랜스퍼하고, SDS gel running할때 준비합니다.) 그뒤 트랜스퍼를 하게되면, 처음 쓰는 트랜스퍼버퍼인데도 불구하고 100V에서 0.38A로 시작하더니 10분도 안되어서 0.40으로 증가합니다. >도저히 안되어서 90V에서 낮추고 하니 한 30분지나서 또 0.40A로 되어버려서 85V에서 2시간 정도 합니다. > >다른 분들이 만들고 쓰던 버퍼를 사용해도, 다른 분들이 만든 새 버퍼를 사용해도 제가 할때만 A가 유독증가하고, 다른 분들은 100V에서 0.29A나 0.35A정도나옵니다. 제가 할때만 100V에서 0.39A로 됩니다.다른분들은 보통 길이의 10%젤을 사용합니다. 원래 100V에서 1시간 반을 해야하나 저는 잘안되어서 80V에서 2시간정도 합니다. 그래도 버퍼나 젤이 뜨겁다는 것을 느낍니다. 잘 트랜스퍼가 되지도 않구요.. >제가 어디를 이상하게 하기에 이렇게 트랜스퍼가 안될까요?? ㅠ.ㅠ >몇개월동안 샘플만 날리네요...ㅠㅠ. 도와주세요..
    앞서 구체적으로 좋은 답변주셨는데, 질문자님이 궁금하신 내용에 조금이나마 도움될까봐 그 원리를 말씀드립니다. 우선 핵심은 트랜스퍼 버퍼를 상온에 보관하셔야 하는 거구요, 4도에 보관하셨다면 상온에서 천천히 stirring을 해줘야 하는데, 버퍼의 물질마다 다르겠지만 제 생각엔 12시간 이상 해줄 필요가 있다고 봅니다. 그리고 그 원리를 살펴보면, 같은 용매 조성에 같은 질량의 용질이 녹아있어도 그 용액의 상태에 따라 전기전도성이 다를 수 있다는 겁니다. 예를 들어 순수한 물의 전기전도도는 낮지만, 극미량의 불순물이 들어가면 전기전도도는 급격히 올라갑니다. 불순물이 없더라도 여러 물질이 녹아있는 용액에서는 그 용질의 입자 사이즈에 따라 전기전도성이 달라집니다. 분자레벨로 고르게 분산되어 있다면 전기에너지가 트랜스퍼 흐름에 집중되어 트랜스퍼 효율도 높아지지만(분리 시간이 짧아지겠지요), 여러 분자가 뭉친 상태로 존재한다면 전기에너지가 입자끼리의 충돌이나 전환 등으로 열 등의 다른 에너지로 전환되며, 그 만큼의 에너지가 트랜스퍼 효율이 떨어지는 결과로 이어지겠지요. 참고로 분산된 용액에서의 입자 사이즈가 작을수록 good dispersion이고 클수록 poor dispersion입니다. 논문이나 자료 검색에 참조하세요. >안녕하세요. >제가 계속 Transfer를 할때면 0.4A 부근에서 시작합니다. >젤은 길이가 좀 긴젤이구요 10%이며, 2판을 트랜스퍼합니다. >트랜스퍼 버퍼는 트리스와 glycine만 들어가고 1L 당 메탄올 200ml을 넣고 >버퍼를 만듭니다. 트리스와 글리신을 다녹이고 total vol. 750ml인 상태에서pH8.5로 맞춘뒤, 800ml로 맞춥니다. 그뒤 메탄올을 200ml 넣고, stir 10초 정도한뒤, 500ml나누어서 2통에 담고 4도에 보관합니다. > >트랜스퍼할 때는 가능한 버퍼를 상온에 잠시 두고 시작합니다,. >membrane은 PVDF입니다. (메탄올로 activation시킨뒤, 트랜스퍼 버퍼에 담은채, 트랜스퍼 할때까지 상온에 둡니다.(당일날 트랜스퍼하고, SDS gel running할때 준비합니다.) 그뒤 트랜스퍼를 하게되면, 처음 쓰는 트랜스퍼버퍼인데도 불구하고 100V에서 0.38A로 시작하더니 10분도 안되어서 0.40으로 증가합니다. >도저히 안되어서 90V에서 낮추고 하니 한 30분지나서 또 0.40A로 되어버려서 85V에서 2시간 정도 합니다. > >다른 분들이 만들고 쓰던 버퍼를 사용해도, 다른 분들이 만든 새 버퍼를 사용해도 제가 할때만 A가 유독증가하고, 다른 분들은 100V에서 0.29A나 0.35A정도나옵니다. 제가 할때만 100V에서 0.39A로 됩니다.다른분들은 보통 길이의 10%젤을 사용합니다. 원래 100V에서 1시간 반을 해야하나 저는 잘안되어서 80V에서 2시간정도 합니다. 그래도 버퍼나 젤이 뜨겁다는 것을 느낍니다. 잘 트랜스퍼가 되지도 않구요.. >제가 어디를 이상하게 하기에 이렇게 트랜스퍼가 안될까요?? ㅠ.ㅠ >몇개월동안 샘플만 날리네요...ㅠㅠ. 도와주세요..
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