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안녕하세요
제가 자료를 찾는 중인데 찾기가 너무 힘들어서 좀 도움을 요청합니다.
amino acid의 크기가 모두 틀리고 그래서 큰게 표면에 노출이 많이 되어있다고 하는데요,
그 amino acid의 표면 노출 값을 구한 논문이 있을까요?
제가 듣기로는 eisenberg D 라는 분이 1980년대에 쓰셨다고 알고 있는데요,
예를들어 ALA과 ALA 사이에 각 amino acid를 넣어 표면에 나타난 부분의 값을 계산한 거라고 합니다.
혹시 아시는 분이 있다면 좀 부탁드리겠습니다.
- amino acid surface area
- SASA
각 분야 한인연구자와 현업 전문가분들의 답변을 기다립니다.
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답변
조민규님의 답변
2011-07-28- 2
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안녕하세요
제가 자료를 찾는 중인데 찾기가 너무 힘들어서 좀 도움을 요청합니다.
amino acid의 크기가 모두 틀리고 그래서 큰게 표면에 노출이 많이 되어있다고 하는데요,
그 amino acid의 표면 노출 값을 구한 논문이 있을까요?
제가 듣기로는 eisenberg D 라는 분이 1980년대에 쓰셨다고 알고 있는데요,
예를들어 ALA과 ALA 사이에 각 amino acid를 넣어 표면에 나타난 부분의 값을 계산한 거라고 합니다.
혹시 아시는 분이 있다면 좀 부탁드리겠습니다.
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질문에 대한 정확한 답은 아니지만,찾고자 하시는게 D. Eisenberg가 만든 것이면, hydrophobicity는 찾을 수 있습니다. 아래의 링크에서 reference를 찾아볼 수 있습니다.http://web.expasy.org/protscale/pscale/Hphob.Eisenberg.html
만약, Solven Accessible Surface Area라면, 각각의 amino acid가 surface에 노출될 빈도도 다르기에 계산하는 과정이 많이 다른 것으로 압니다. 아래 논문을 참고해보셔도 좋을 듯 합니다.
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2712621/
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답변
심용호님의 답변
2011-08-01- 2
아래 논문이 도움을 줄수있을것 같습니다.
Three-dimensional structure of membrane and surface proteins.
Eisenberg D.
Annu Rev Biochem. 1984;53:595-623. Review. No abstract available.